SCT Promoter Methylation Is a Highly Discriminative Biomarker for Lung and Many Other Cancers
Notice bibliographique
Résumé
Aberrant DNA methylation has long been implicated in cancers. In this letter, we present a highly discriminative DNA methylation biomarker for non-small cell lung cancers (NSCLCs) and 14 other cancers. Based on 69 NSCLC cell lines and 257 cancer-free lung tissues, we identified a CpG island in SCT gene promoter, which was verified by qMSP experiment in 15 NSCLC cell lines and three immortalized human respiratory epithelium cells. In addition, we found that the SCT promoter was methylated in 23 cancer cell lines involving >10 cancer types profiled by ENCODE. We found that the SCT promoter is hypermethylated in primary tumors from TCGA lung cancer cohort. In addition, we found that SCT promoter is methylated at high frequencies in 15 malignancies and is not methylated in ~1000 non-cancerous tissues across >30 organ types. This letter indicates that SCT promoter methylation is a highly discriminative biomarker for lung and many other cancers.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».