MétaCan
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Enregistrement W2950453293 · doi:10.3897/biss.3.37333

BIOSCAN - Revealing Eukaryote Diversity, Dynamics, and Interactions

2019· article· en· W2950453293 sur OpenAlex
Donald Hobern, Paul D. N. Hebert

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueBiodiversity Information Science and Standards · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEnvironmental DNA in Biodiversity Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBarcodeDNA barcodingBiodiversityBiologyEcologySpecies diversityGlobal biodiversityEnvironmental resource managementLibrary scienceComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Between 2010 and 2015, the International Barcode of Life (iBOL) consortium successfully completed the BARCODE 500K project, a $125 million effort that delivered DNA barcode coverage for 500,000 species. BIOSCAN is a seven-year program (2019-2025) that builds on this foundation, expanding coverage of the barcode reference library to two million species and operationalising metabarcoding for eukaryote communities globally. BIOSCAN will scan species assemblages from at least 2,500 ecosystems and will codify species interactions for at least 2,500 sites. DNA barcoding is a well-established approach for rapid, cost-effective species diagnosis, with many applications in support of taxonomy, biosecurity, conservation, and monitoring. Uptake has been particularly significant in hyperdiverse invertebrate groups where morphological approaches to species identification are often limiting (because of the scale of diversity and the small number of expert taxonomists) or inapplicable (for example in associating individuals from different life stages). The barcode reference library maintained as BOLD Systems by the Centre for Biodiversity Genomics in Guelph, Ontario is a significant biodiversity informatics infrastructure for bridging genomics and classical taxonomy, collections research, and field surveys. Effort across multiple years in Canada has delivered a library of reference sequences for the COI mitochondrial barcode that covers most of the known insect fauna for the country, enabling a comprehensive assessment of Canadian arthropod diversity (Hebert et al. 2016, Langor and Sheffield 2019). The Global Malaise Trap Program is expanding lessons learned in Canada to support species inventories in new regions such as Kruger National Park in South Africa. As DNA barcode libraries approach completeness for any site, analysis can employ metabarcoding to lower costs significantly for monitoring programs that track changes in species composition. Data from this program, and from barcode-based exploration in other regions, will greatly expand the fraction of biodiversity that can be monitored and compared over time and space. GBIF has collected more than one billion species records, but around 60% of these are for birds, with another 25% for vascular plants. Metabarcoding offers the opportunity for a wider selection of taxa to be included in global data sets and in support of local conservation and planning. The BIOSCAN program, launched by iBOL in 2019, seeks to operationalise DNA barcoding at the global scale for development of species inventories and preliminary exploration of undescribed diversity, for surveying community composition across the world's ecosystems, and codifying species interactions (the symbiome). BIOSCAN will exploit the latest advances in sequencing platforms to lower costs, increase precision, and accelerate processing of samples, to speed the uptake of DNA barcoding for protecting life on Earth.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,029
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0000,004
Science ouverte0,0000,003
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle