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Enregistrement W2950601502 · doi:10.1111/eva.12754

Population genomic analyses reveal a highly differentiated and endangered genetic cluster of northern goshawks ( <i>Accipiter gentilis laingi</i> ) in Haida Gwaii

2018· article· en· W2950601502 sur OpenAlexafffundabout
Armando Geraldes, Kenneth K. Askelson, Ellen Nikelski, Frank I. Doyle, William L. Harrower, Kevin Winker, Darren E. Irwin

Notice bibliographique

RevueEvolutionary Applications · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensUniversity of VictoriaUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGenome British Columbia
Mots-clésBiologySubspeciesPopulationThreatened speciesRange (aeronautics)Endangered speciesConservation geneticsEcologyZoologyEvolutionary biologyMicrosatelliteDemographyHabitatGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Accurate knowledge of geographic ranges and genetic relationships among populations is important when managing a species or population of conservation concern. Along the western coast of Canada, a subspecies of the northern goshawk ( Accipiter gentilis laingi ) is legally designated as Threatened. The range and distinctness of this form, in comparison with the broadly distributed North American subspecies ( Accipiter gentilis atricapillus ), is unclear. Given this morphological uncertainty, we analyzed genomic relationships in thousands of single nucleotide polymorphisms identified using genotyping‐by‐sequencing of high‐quality genetic samples. Results revealed a genetically distinct population of northern goshawks on the archipelago of Haida Gwaii and subtle structuring among other North American sampling regions. We then developed genotyping assays for ten loci that are highly differentiated between the two main genetic clusters, allowing inclusion of hundreds of low‐quality samples and confirming that the distinct genetic cluster is restricted to Haida Gwaii. As the laingi form was originally described as being based on Haida Gwaii (where the type specimen is from), further morphological analysis may result in this name being restricted to the Haida Gwaii genetic cluster. Regardless of taxonomic treatment, the distinct Haida Gwaii genetic cluster along with the small and declining population size of the Haida Gwaii population suggests a high risk of extinction of an ecologically and genetically distinct form of northern goshawk. Outside of Haida Gwaii, sampling regions along the coast of BC and southeast Alaska (often considered regions inhabited by laingi ) show some subtle differentiation from other North American regions. These results will increase the effectiveness of conservation management of northern goshawks in northwestern North America. More broadly, other conservation‐related studies of genetic variation may benefit from the two‐step approach we employed that first surveys genomic variation using high‐quality samples and then genotypes low‐quality samples at particularly informative loci.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,196
Score d'incertitude au seuil0,544

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2018
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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