Hypoxia-induced reprogramming of the cardiac phenotype in American alligators (Alligator mississippiensis) revealed by quantitative proteomics
Notice bibliographique
Résumé
Hypoxic exposure during development can have a profound influence on offspring physiology, including cardiac dysfunction, yet many reptile embryos naturally experience periods of hypoxia in buried nests. American alligators experimentally exposed to developmental hypoxia demonstrate morphological and functional changes to the heart that persist into later life stages; however, the molecular bases of these changes remain unknown. We tested if targeted and persistent changes in steady-state protein expression underlie this hypoxic heart phenotype, using isobaric tags for relative and absolute quantitation (iTRAQ) proteomics. Alligator eggs were reared under normoxia or 10% hypoxia, then either sampled (embryo) or returned to normoxia for 2 years (juvenile). Three salient findings emerge from the integrated analysis of the 145 differentially expressed proteins in hypoxia-reared animals: (1) significant protein-protein interaction networks were identified only in up-regulated proteins, indicating that the effects of developmental hypoxia are stimulatory and directed; (2) the up-regulated proteins substantially enriched processes related to protein turnover, cellular organization, and metabolic pathways, supporting increased resource allocation towards building and maintaining a higher functioning heart; and (3) the juvenile cardiac proteome retained many of the signature changes observed in embryonic hearts, supporting long-term reprogramming of cardiac myocytes induced by hypoxia during critical periods of development.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».