MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2950678775 · doi:10.7717/peerj.7100

Identification and characterization of <i>Gypsophila paniculata</i> color morphs in Sleeping Bear Dunes National Lakeshore, MI, USA

2019· article· en· W2950678775 sur OpenAlexaboutno aff
Marisa Yang, Emma Rice, Hailee Leimbach-Maus, Charlyn Partridge

Notice bibliographique

RevuePeerJ · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Gene Expression Analysis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPhylogenetic treeInternal transcribed spacerBotanyEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Gypsophila paniculata (baby’s breath) is an invasive species found throughout much of the northwest United States and western Canada. Recently, plants exhibiting a different color morphology were identified within the coastal dunes along eastern Lake Michigan. The common baby’s breath ( G. paniculata ) typically produces stems that are purple in color (purple morph), while the atypical morph has stems that are green-yellow (green-yellow morph). The purpose of this study was to characterize these newly identified morphs and determine if they are genetically distinct species from the common baby’s breath in order to assess whether alternative management strategies should be employed to control these populations. Methods We sequenced two chloroplast regions, ribulose-bisphosphate carboxylase gene (rbcL), and maturase K (matK), and one nuclear region, internal transcribed spacer 2 (ITS2), from the purple morphs and green-yellow morphs collected from Sleeping Bear Dunes National Lakeshore, MI, USA (SBDNL). Sequences were aligned to reference sequences from other Gypsophila species obtained from the Barcode of Life Database and GenBank databases. We also collected seeds from wild purple morph and wild green-yellow morph plants in SBDNL. We grew the seeds in a common garden setting and characterized the proportion of green-yellow individuals produced from the two color morphs after 5-months of growth. Results Phylogenetic analyses based upon rbcL, matK, and ITS2 regions suggest that the two color morphs are not distinct species and they both belong to G. paniculata . Seeds collected from wild green-yellow morphs produced a significantly higher proportion of green-yellow individuals compared to the number produced by seeds collected from wild purple morphs. However, seeds collected from both color morphs produced more purple morphs than green-yellow morphs. Discussion Based upon these results, we propose that the two color morphs are variants of G. paniculata . Given the significant difference in the number of green-yellow morphs produced from the seeds of each morph type, we also suggest that this color difference has some genetic basis. We propose that current management continue to treat the two color morphs in a similar manner in terms of removal to prevent the further spread of this species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,198
Score d'incertitude au seuil0,278

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePeerJMême sujetPlant Gene Expression AnalysisTravaux en français237 207