The 6-Methoxymethyl Derivative Of Pyrrolo-Dc For Selective Fluorometric Detection Of Guanosine-Containing Sequences
Notice bibliographique
Résumé
The beta-cyanoethyl phosphosphoramidite derivatives of 6-methyl- and 6-methoxymethyl-3-(2-deoxy-beta-D-ribofuranosyl)-3H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-2-one have been synthesized. These monomers have been employed for oligodeoxynucleotide synthesis to evaluate their effect on duplex stability and ability to fluorometrically report on hybridization. The structurally conservative 6-methoxymethyl-substitution results in a pyrrolocytidine that is stabilizing toward hybrid formation (Delta Tm = +1.3 degrees C) whereas the known 6-methylpyrrolocytidine is destabilizing (Delta Tm = -4.7 degrees C), in the sequence examined. The 6-methoxymethylpyrrolocytidine retains excellent mismatch discrimination and its fluorescence is selectively quenched when hybridized to a match oligodeoxynucleotide sequence. The quenching of fluorescence for an internal position is approximately three-fold, whereas a terminal position (5'-end or 3'-end) experienced approximately two-fold decrease in the fluorescence intensity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».