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Enregistrement W2950802476 · doi:10.5539/jmbr.v9n1p53

Application of the 3'-Untranslated Region of Messenger RNA from Measles Virus Matrix Protein as an RNA Stabilizer: Implications in Pharmaceutical Biotechnology

2019· article· en· W2950802476 sur OpenAlexvenueno aff
Marzieh Marzbany, Fatemeh Ghassemi, Mahsa Rasekhian

Notice bibliographique

RevueJournal of Molecular Biology Research · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVirus-based gene therapy research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésUntranslated regionThree prime untranslated regionMessenger RNAMeasles virusRNAProtein biosynthesisTranslation (biology)BiologyFive prime untranslated regionMolecular biologyTransfectionGeneticsGeneVirologyMeasles

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The market for the use of recombinant proteins for medical applications has been increasing in recent years. In many cases including fast production of significant amounts of protein for research purposes, transient transfection is the method of choice. In this regard expression vectors are one of the decisive factors in the cost-effectiveness of the production process. The genetic elements found in the 3’untranslated region (UTR) of mRNA expressed by such vectors, play an essential role in determining its stability and thus in the efficiency of the process. METHODS: In this study, the 3'UTR of matrix protein from the Measles Virus (MV) was used to construct a reporter plasmid containing Enhanced Green Fleurocent Protein (EGFP). The reporter construct was transfected into three cell lines. The effect of 3'UTR on mRNA stability was evaluated by real-time PCR. Secondary structure of the mrna was predicted based on minimum free energy. 3'UTR was analyzed in silico for the presence of binding motifs for trans-acting elements with known effects on RNA stability. RESULTS: Addition of 3’UTR of MV matrix protein sequence to the 3’ end of the mRNA, increased the EGFP- mRNA stability in time and cell-dependent manner. Analysis for the presence of known cis-acting motifs in 3’UTR indicated the presence of two PABPC1 binding sites, an RNA-binding protein, known for its stability and translation enhancing effects. CONCLUSION: Our results verified the potential of the 3'UTR region of matrix protein mRNA for improvement of transient recombinant protein production and vector design for mammalian cell hosts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,550

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,419
Écart entre enseignants0,374 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
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Résumé présentoui

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