Assessing the relationship between height growth and molecular genetic variation in Douglas-fir ( <i>Pseudotsuga menziesii</i> ) provenances
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Douglas-fir ( Pseudotsuga menziesii ) is a conifer tree native to western North America. In central Europe, it shows superior growth performance and is considered a suitable substitute for tree species impaired in vitality due to climate change. Maintenance and improvement of growth performance in a changing environment is a main challenge for forest tree breeders. In this context, genetic variation as a factor underlying phenotypic variation, but also as the basis for future adaptation, is of particular interest. The aims of this study were to analyse (i) genetic diversity of selected Douglas-fir provenances, (ii) variation in height growth among provenances, and (iii) to assess the link between genetic and phenotypic variation height growth. Genotyping was done on microsatellite loci. Effects of ‘provenance’, ‘genotype’, and ‘site’ on height growth were assessed by fitting mixed linear models. The most significant genetic differentiation was observed between provenances of the coastal variety, versus a provenance of the interior variety originating from British Columbia. Although genetic differentiation among provenances of the coastal variety was lower, genetic structures within this variety were identified. Moreover, genetic diversity showed a latitudinal gradient with the southernmost provenances being more diverse, probably reflecting the species' evolutionary history. The modelling approach revealed that height growth differed significantly by provenance, site, and the interaction between site and provenance, demonstrating that height growth is under strong genetic control. Additionally, this analysis showed that genetic variation captured by the genotyped microsatellite loci was significantly related to variation in height growth, providing statistical evidence for a genetic component in the observed phenotypic variation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».