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Enregistrement W2950897493 · doi:10.1101/463315

Transmission of mechanical information by purinergic signaling

2018· preprint· en· W2950897493 sur OpenAlexafffund
Nicholas Mikolajewicz, Simon Sehayek, Paul W. Wiseman, Svetlana V. Komarova

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2018
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdenosine and Purinergic Signaling
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchRéseau de Recherche en Santé Buccodentaire et OsseuseNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMcGill University
Mots-clésPurinergic receptorExtracellularStimulationPurinergic signallingCell biologyIntracellularBiophysicsChemistryCalciumBiologyBiochemistryNeuroscienceReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

1 Abstract The human skeleton constantly interacts and adapts to the physical world. We have previously reported that physiologically-relevant mechanical forces lead to small, repairable membrane injuries in bone-forming osteoblasts, resulting in the release of ATP and stimulation of purinergic (P2) calcium responses in neighbouring cells. The goal of this study was to develop a theoretical model describing injury-related ATP and ADP release, extracellular diffusion and degradation, and purinergic responses in neighboring cells. The model was validated using experimental data obtained by measuring intracellular free calcium ([Ca 2+ ] i ) elevations following mechanical stimulation of a single osteoblast. The validated single-cell injury model was then scaled to a tissue-level injury to investigate how purinergic responses communicate information about injuries with varying geometries. We found that total ATP released, peak extracellular ATP concentration and the ADP-mediated signaling component contributed complementary information regarding the mechanical stimulation event. The total amount of ATP released governed the maximal distance from the injury at which purinergic responses were stimulated, as well as the overall number of responders. The peak ATP concentration reflected the severity of an individual cell injury and determined signal propagation velocity and temporal synchrony of responses. Peak ATP concentrations also discriminated between minor and severe injuries that led to the release of similar total amounts of ATP due to differences in injury repair dynamics. The third component was ADP-mediated signaling which became relevant only in larger tissue-level injuries, and it conveyed information about the distance to the injury site and its geometry. Taken together, this study identified specific features of extracellular ATP/ADP spatiotemporal signals that encode the severity of the mechanical stimulus, the distance from the stimulus, as well as the mechano-resilient status of the tissue.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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