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Enregistrement W2951046605 · doi:10.1101/064295

Bayesian model reveals latent atrophy factors with dissociable cognitive trajectories in Alzheimer’s disease

2016· preprint· en· W2951046605 sur OpenAlexfundno aff
Xiuming Zhang, Elizabeth C. Mormino, Nanbo Sun, Reisa A. Sperling, Mert R. Sabuncu, B.T. Thomas Yeo

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2016
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingNational Medical Research CouncilNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchAthinoula A. Martinos Center for Biomedical Imaging, Massachusetts General HospitalUniversity of California, San DiegoNational Institutes of HealthGenentechIXICOH. Lundbeck A/SServierEisaiCentre d'Imagerie BioMédicalePfizerBiogenMinistry of Education, IndiaBioClinicaF. Hoffmann-La RocheUniversity of Southern CaliforniaNorthern California Institute for Research and EducationMassachusetts General HospitalNovartis Pharmaceuticals CorporationU.S. Department of DefenseEli Lilly and CompanyBristol-Myers SquibbAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeMeso Scale DiagnosticsAlzheimer's AssociationFoundation for the National Institutes of Health
Mots-clésAtrophyPsychologyNeuroscienceCognitionDementiaNeuroimagingCognitive declineHippocampusPutamenDiseasePathologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract We employed a data-driven Bayesian model to automatically identify distinct latent factors of overlapping atrophy patterns from voxelwise structural magnetic resonance imaging (MRI) of late-onset Alzheimer’s disease (AD) dementia patients. Our approach estimated the extent to which multiple distinct atrophy patterns were expressed within each participant rather than assuming that each participant expressed a single atrophy factor. The model revealed a temporal atrophy factor (medial temporal cortex, hippocampus and amygdala), a subcortical atrophy factor (striatum, thalamus and cerebellum), and a cortical atrophy factor (frontal, parietal, lateral temporal and lateral occipital cortices). To explore the influence of each factor in early AD, atrophy factor compositions were inferred in beta-amyloid-positive (Aβ+) mild cognitively impaired (MCI) and cognitively normal (CN) participants. All three factors were associated with memory decline across the entire clinical spectrum, whereas the cortical factor was associated with executive function decline in Aβ+ MCI participants and AD dementia patients. Direct comparison between factors revealed that the temporal factor showed the strongest association with memory, while the cortical factor showed the strongest association with executive function. The subcortical factor was associated with the slowest decline for both memory and executive function compared to temporal and cortical factors. These results suggest that distinct patterns of atrophy influence decline across different cognitive domains. Quantification of this heterogeneity may enable the computation of individual-level predictions relevant for disease monitoring and customized therapies. Code from this manuscript is publicly available at link_to_be_added.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,017
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,022
Score d'incertitude au seuil0,045

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,017
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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