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Enregistrement W2951102953 · doi:10.1093/femsec/fiy110

Dispersal limitation and thermodynamic constraints govern spatial structure of permafrost microbial communities

2018· article· en· W2951102953 sur OpenAlexaff
Eric Bottos, David W. Kennedy, Elvira Romero, Sarah Fansler, Joseph Brown, Lisa Bramer, Rosalie Chu, Malak Tfaily, Janet Jansson, James Stegen

Notice bibliographique

RevueFEMS Microbiology Ecology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueClimate change and permafrost
Établissements canadiensThompson Rivers University
Organismes subventionnairesPacific Northwest National LaboratoryLaboratory Directed Research and DevelopmentBattelleU.S. Department of Energy
Mots-clésPermafrostBiological dispersalEcologyBiologyMicrobial population biologyEcosystemOrganic matterSelection (genetic algorithm)Community structurePopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Understanding drivers of permafrost microbial community composition is critical for understanding permafrost microbiology and predicting ecosystem responses to thaw. We hypothesize that permafrost communities are shaped by physical constraints imposed by prolonged freezing, and exhibit spatial distributions that reflect dispersal limitation and selective pressures associated with these physical constraints. To test this, we characterized patterns of environmental variation and microbial community composition in permafrost across an Alaskan boreal forest landscape. We used null modeling to estimate the importance of selective and neutral assembly processes on community composition, and identified environmental factors influencing ecological selection through regression and structural equation modeling (SEM). Proportionally, the strongest process influencing community composition was dispersal limitation (0.36), exceeding the influence of homogenous selection (0.21), variable selection (0.16) and homogenizing dispersal (0.05). Fe(II) content was the most important factor explaining variable selection, and was significantly associated with total selection by univariate regression (R2 = 0.14, P = 0.003). SEM supported a model in which Fe(II) content mediated influences of the Gibbs free energy of the organic matter pool and organic acid concentration on total selection. These findings suggest that the dominant processes shaping microbial communities in permafrost result from the stability of the permafrost environment, which imposes dispersal and thermodynamic constraints.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,398
Score d'incertitude au seuil0,990

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0110,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations100
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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