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Enregistrement W2951320022 · doi:10.14309/ajg.0000000000000305

The Gut Microbiome in Inflammatory Bowel Disease: Lessons Learned From Other Immune-Mediated Inflammatory Diseases

2019· review· en· W2951320022 sur OpenAlexafffund
Natalie Knox, Jessica D. Forbes, Christy-Lynn Peterson, Gary Van Domselaar, Çharles N. Bernstein

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Gastroenterology · 2019
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of ManitobaPublic Health Agency of Canada
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMicrobiomeDysbiosisInflammatory bowel diseaseMedicineDiseaseGut floraImmunologyImmune systemGut microbiomePathogenesisBioinformaticsBiologyPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

There is a growing appreciation for the role of the gut microbiome in human health and disease. Aided by advances in sequencing technologies and analytical methods, recent research has shown the healthy gut microbiome to possess considerable diversity and functional capacity. Dysbiosis of the gut microbiota is believed to be involved in the pathogenesis of not only diseases that primarily affect the gastrointestinal tract but also other less obvious diseases, including neurologic, rheumatologic, metabolic, hepatic, and other illnesses. Chronic immune-mediated inflammatory diseases (IMIDs) represent a group of diseases that share many underlying etiological factors including genetics, aberrant immunological responses, and environmental factors. Gut dysbiosis has been reported to be common to IMIDs as a whole, and much effort is currently being directed toward elucidating microbiome-mediated disease mechanisms and their implications for causality. In this review, we discuss gut microbiome studies in several IMIDs and show how these studies can inform our understanding of the role of the gut microbiome in inflammatory bowel disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations84
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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