Inherited duplications of <i>PPP2R3B</i> promote naevi and melanoma via a novel <i>C21orf91</i> -driven proliferative phenotype
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The majority of the heredity of melanoma remains unexplained, however inherited copy number changes have not yet been systematically studied. The genetic environment is highly relevant to treatment stratification, and new gene discovery is therefore desirable. Using an unbiased whole genome screening approach for copy number we identify here a novel melanoma predisposing factor, familial duplications of gene PPP2R3B , encoding a regulatory unit of critical phosphatase PP2A. Significant correlation between expression of PPP2R3B in tumour tissue and survival in a large melanoma cohort was confirmed, and associated with a non-immunological expression profile. Mechanistically, construction and extensive characterization of a stable, inducible cellular model for PPP2R3B overexpression revealed induction of pigment cell switching towards proliferation and away from migration. Importantly, this was independent of the known microphthalmia-associated transcription factor (MITF) -controlled pigment cell phenotype switch, and was instead driven by uncharacterised gene C21orf91 . Bioinformatic studies point to C21orf91 as a novel target of MITF, and therefore a potential hub in the control of phenotype switching in melanoma. This study identifies novel germline copy number variants in PPP2R3B predisposing to melanocytic neoplasia, and uncovers a new potential therapeutic target C21orf91 in the control of pigment cell proliferation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».