MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2951506965 · doi:10.1038/s41598-019-44991-w

Identification of a Radiosensitivity Molecular Signature Induced by Enzalutamide in Hormone-sensitive and Hormone-resistant Prostate Cancer Cells

2019· article· en· W2951506965 sur OpenAlexaff
Maryam Ghashghaei, Tamim Niazi, Adriana Aguilar‐Mahecha, Kathleen Klein, Celia M.T. Greenwood, Mark Basik, Thierry Muanza

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Treatment and Research
Établissements canadiensMcGill Genome CentreMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLNCaPEnzalutamideProstate cancerCancer researchRadiosensitivityGene signatureBiologyCancerInternal medicineOncologyAndrogen receptorMedicineGeneGene expressionRadiation therapyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Prostate cancer (PCa) is the most common cancer amongst men. A novel androgen receptor (AR) antagonist, enzalutamide (ENZA) has recently been demonstrated to enhance the effect of radiation (XRT) by impairing the DNA damage repair process. This study aimed to identify a radiosensitive gene signature induced by ENZA in the PCa cells and to elucidate the biological pathways which influence this radiosensitivity. We treated LNCaP (AR-positive, hormone-sensitive PCa cells) and C4-2 (AR-positive, hormone-resistant PCa cells) cells with ENZA alone and in combination with androgen deprivation therapy (ADT) and XRT. Using one-way ANOVA on the gene expression profiling, we observed significantly differentially expressed (DE) genes in inflammation-and metabolism-related genes in hormone-sensitive and hormone-resistant PCa cell lines respectively. Survival analysis in both the TCGA PRAD and GSE25136 datasets suggested an association between the expression of these genes and time to recurrence. These results indicated that ENZA alone or in combination with ADT enhanced the effect of XRT through immune and inflammation-related pathways in LNCaP cells and metabolic-related pathways in C4-2 cells. Kaplan-Meier analysis and Cox proportional hazard models showed that low expression of all the candidate genes except for PTPRN2 were associated with tumor progression and recurrence in a PCa cohort.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueScientific ReportsMême sujetProstate Cancer Treatment and ResearchTravaux en français237 207