MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2951543504 · doi:10.1093/infdis/jiz298

Compartmentalization of a Multidrug-Resistant Cytomegalovirus UL54 Mutant in a Stem Cell Transplant Recipient with Encephalitis

2019· article· en· W2951543504 sur OpenAlexafffund
Jocelyne Piret, Manuel Schibler, Văn Dũng Phạm, Sébastien Hantz, Federica Giannotti, Stavroula Masouridi‐Levrat, Laurent Kaiser, Nathalie Goyette, Sophie Alain, Rong Shi, Guy Boivin

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Infectious Diseases · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytomegalovirus and herpesvirus research
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAmerican University of Beirut
Mots-clésVirologyFoscarnetBiologyCidofovirCytomegalovirusHuman cytomegalovirusEncephalitisVirusGanciclovirHerpesviridaeViral disease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We report a case of cytomegalovirus encephalitis in a hematopoietic stem cell transplant recipient. A previously uncharacterized V787E mutation in UL54 was identified in cerebrospinal fluid but not plasma specimens. For the V787E recombinant virus, the half maximal effective concentrations for ganciclovir, foscarnet, and cidofovir were 8.6-, 3.4- and 2.9-fold higher than for wild-type virus, and the replicative capacity was lower. The introduction of a bulkier and negatively charged glutamate residue at position 787 could destabilize the finger domain of UL54 DNA polymerase. Viral genotyping of cerebrospinal fluid is warranted in subjects with cytomegalovirus encephalitis, owing to the low penetration of antivirals in this compartment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Journal of Infectious DiseasesMême sujetCytomegalovirus and herpesvirus researchTravaux en français237 207