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Enregistrement W2951588804 · doi:10.1038/s41380-018-0321-0

Big data approaches to decomposing heterogeneity across the autism spectrum

2019· review· en· W2951588804 sur OpenAlexafffund
Michael Lombardo, Meng‐Chuan Lai, Simon Baron‐Cohen

Notice bibliographique

RevueMolecular Psychiatry · 2019
Typereview
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueAutism Spectrum Disorder Research
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoSickKids FoundationCentre for Addiction and Mental Health
Organismes subventionnairesEuropean Research CouncilMedical Research CouncilDepartment of Psychiatry, University of TorontoOntario Brain InstituteHospital for Sick ChildrenCentre for Addiction and Mental Health FoundationInnovative Medicines InitiativeEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsAutism SpeaksUniversity of TorontoNational Institute for Health and Care ResearchEuropean CommissionSimons Foundation Autism Research InitiativeCentre for Addiction and Mental Health
Mots-clésAutismPsychologyAutism spectrum disorderMEDLINEData scienceCognitive psychologyComputer sciencePsychiatryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Autism is a diagnostic label based on behavior. While the diagnostic criteria attempt to maximize clinical consensus, it also masks a wide degree of heterogeneity between and within individuals at multiple levels of analysis. Understanding this multi-level heterogeneity is of high clinical and translational importance. Here we present organizing principles to frame research examining multi-level heterogeneity in autism. Theoretical concepts such as 'spectrum' or 'autisms' reflect non-mutually exclusive explanations regarding continuous/dimensional or categorical/qualitative variation between and within individuals. However, common practices of small sample size studies and case-control models are suboptimal for tackling heterogeneity. Big data are an important ingredient for furthering our understanding of heterogeneity in autism. In addition to being 'feature-rich', big data should be both 'broad' (i.e., large sample size) and 'deep' (i.e., multiple levels of data collected on the same individuals). These characteristics increase the likelihood that the study results are more generalizable and facilitate evaluation of the utility of different models of heterogeneity. A model's utility can be measured by its ability to explain clinically or mechanistically important phenomena, and also by explaining how variability manifests across different levels of analysis. The directionality for explaining variability across levels can be bottom-up or top-down, and should include the importance of development for characterizing changes within individuals. While progress can be made with 'supervised' models built upon a priori or theoretically predicted distinctions or dimensions of importance, it will become increasingly important to complement such work with unsupervised data-driven discoveries that leverage unknown and multivariate distinctions within big data. A better understanding of how to model heterogeneity between autistic people will facilitate progress towards precision medicine for symptoms that cause suffering, and person-centered support.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,042
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,136
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,042
Score d'incertitude au seuil0,220

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0420,136
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,005
Bibliométrie0,0150,017
Études des sciences et des technologies0,0030,005
Communication savante0,0090,010
Science ouverte0,0060,011
Intégrité de la recherche0,0040,007
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,389
Tête enseignante GPT0,412
Écart entre enseignants0,024 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations553
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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