The use of mass spectrometry for the characterization of molecules co-purifying with integrins
Notice bibliographique
Résumé
Cellular adhesion has been demonstrated to involve supramolecular complexes on plasma membranes of various cell types. These complexes involve not only transmembrane molecules, but rather extend into the cytoplasm to include signal transduction elements, adaptor proteins, and cytoskeletal components. Alterations in activation status or adhesion status of the cell lead to changes in specific associations within the complex. This dynamic process is believed to be mediated through post-translational events which modify the ability of various components to associate with or cross-link other elements. This reversible process of cellular adhesion is necessary for cellular migration through tissue. As adhesion molecules, integrins have a significant contribution to the functioning of these elaborate structures. Mass spectrometry has been used for the characterization of unidentified biomolecules, but this approach has not been utilized for analysis of supramolecular adhesion complexes. To test the validity of applying this technology to supramolecular complexes, proteins co-purifying with the integrin alpha-v/beta-3 were recovered from silver-stained SDS-PAGE gels and analyzed on a MALDI qQ-TOF. Using this approach, the protein(s) contained within each band on the gel could be identified. These findings support the use of mass spectrometry for the characterization of molecules co-purifying with integrins.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».