Transcription Promotes the Interaction of the FAcilitates Chromatin Transactions (FACT) Complex with Nucleosomes in <i>Saccharomyces cerevisiae</i>
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Abstract FACT (FAcilitates Chromatin Transactions) is an abundant and conserved complex that is essential for cell viability. FACT binds to highly expressed genes and facilitates transcription while maintaining chromatin structure, but how it is targeted... The FACT (FAcilitates Chromatin Transactions) complex is a conserved complex that maintains chromatin structure on transcriptionally active genes. Consistent with this, FACT is enriched on highly expressed genes, but how it is targeted to these regions is unknown. In vitro, FACT binds destabilized nucleosomes, supporting the hypothesis that FACT is targeted to transcribed chromatin through recognition of RNA polymerase (RNAP)-disrupted nucleosomes. In this study, we used high-resolution analysis of FACT occupancy in Saccharomyces cerevisiae to test this hypothesis. We demonstrate that FACT interacts with nucleosomes in vivo and that its interaction with chromatin is dependent on transcription by any of the three RNAPs. Deep sequencing of micrococcal nuclease-resistant fragments shows that FACT-bound nucleosomes exhibit differing nuclease sensitivity compared to bulk chromatin, consistent with a modified nucleosome structure being the preferred ligand for this complex. Interestingly, a subset of FACT-bound nucleosomes may be “overlapping dinucleosomes,” in which one histone octamer invades the ∼147-bp territory normally occupied by the adjacent nucleosome. While the differing nuclease sensitivity of FACT-bound nucleosomes could also be explained by the demonstrated ability of FACT to alter nucleosome structure, transcription inhibition restores nuclease resistance, suggesting that it is not due to FACT interaction alone. Collectively, these results are consistent with a model in which FACT is targeted to transcribed genes through preferential interaction with RNAP-disrupted nucleosomes.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle