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Enregistrement W2952166052

Increasing Breeding Without Breeding (BwB) Efficiency: Full Vs. Partial-Pedigree Reconstruction in Lodgepole Pine

2017· preprint· en· W2952166052 sur OpenAlex
Yousry A. El‐Kassaby, Tomáš Funda, Cherdsak Liewlaksaneeyanawin

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueviXra · 2017
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOffspringPopulationBiologyMicrosatelliteSampling (signal processing)GeneticsStatisticsMathematicsDemographyComputer scienceGene
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The advantage of paternity assignment in assembling structured pedigree for breeding is investigated using two sampling methods; namely, family array (known maternal parent) and random offspring (unknown maternal and paternal parents) collected from an openpollinated lodgepole pine experimental population with known parents (N = 74) using nuclear and chloroplast microsatellite markers. Offspring of equivalent sample sizes representing the family array (n = 619) and random offspring (n = 635) were genotyped and subjected to partial and full pedigree reconstruction, respectively. The full pedigree reconstruction assembled substantially larger number of full-sib families than the partial (446 vs. 268) and interestingly the two methods detected equivalent amount of external gene flow to the experimental population. The superiority of the random offspring over the family array sampling in producing more full-sib families was attributed to its better representation of the parental population, as random sampling included offspring from most parents as compared to the parent-limited family array. Owing to the observed advantages, the full pedigree reconstruction could be employed as an alternative to the breeding phase commonly required in conventional breeding programs for the development of structured pedigree needed for genetic parameters estimation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,431
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle