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Enregistrement W2952296879 · doi:10.1101/679233

Cryo-EM structure of the complete and ligand-saturated insulin receptor ectodomain

2019· preprint· en· W2952296879 sur OpenAlexaff
Theresia Gutmann, Ingmar B. Schäfer, Chetan Poojari, Beate Brankatschk, Ilpo Vattulainen, Mike Strauss, Ünal Coskun

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Structure and Dynamics
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesLeibniz-RechenzentrumMax-Planck-Institut für BildungsforschungAcademy of FinlandBayerische Akademie der WissenschaftenChina Scholarship CouncilLeibniz-GemeinschaftTechnische Universität DresdenDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésEctodomainInsulin receptorInsulinIRS2Insulin receptor substrateBiophysicsGRB10ReceptorChemistryBiologyCell biologyBiochemistryEndocrinologyInsulin resistance

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Glucose homeostasis and growth essentially depend on the peptide hormone insulin engaging its receptor. Despite biochemical and structural advances, a fundamental contradiction has persisted in the current understanding of insulin ligand–receptor interactions. While biochemistry predicts two distinct insulin binding sites, 1 and 2, recent structural analyses have only resolved site 1. Using a combined approach of cryo-EM and atomistic molecular dynamics simulation, we determined the structure of the entire dimeric insulin receptor ectodomain saturated with four insulin molecules. Complementing the previously described insulin–site 1 interaction, we present the first view of insulin bound to the discrete insulin receptor site 2. Insulin binding stabilizes the receptor ectodomain in a T-shaped conformation wherein the membrane-proximal domains converge and contact each other. These findings expand the current models of insulin binding to its receptor and of its regulation. In summary, we provide the structural basis enabling a comprehensive description of ligand–receptor interactions that ultimately will inform new approaches to structure-based drug design. In brief A cryo-EM structure of the complete insulin receptor ectodomain saturated with four insulin ligands is reported. The structural model of the insulin–insulin receptor complex adopts a T-shaped conformation, reveals two additional insulin-binding sites potentially involved in the initial interaction of insulin with its receptor, and resolves the membrane proximal region.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,057
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,195
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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