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Enregistrement W2952400570 · doi:10.1038/s41467-019-09555-6

Multiple myeloma immunoglobulin lambda translocations portend poor prognosis

2019· article· en· W2952400570 sur OpenAlexaff
Benjamin G. Barwick, Paola Neri, Nizar J. Bahlis, Ajay K. Nooka, Madhav V. Dhodapkar, David L. Jaye, Craig C. Hofmeister, Jonathan L. Kaufman, Vikas A. Gupta, Daniel Auclair, Jonathan J. Keats, Sagar Lonial, Paula M. Vertino, Lawrence Boise

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMultiple Myeloma Research and Treatments
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesWinship Cancer InstituteSteadman Philippon Research InstituteEmory UniversityMultiple Myeloma Research FoundationNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthAmerican Cancer Society
Mots-clésChromosomal translocationMultiple myelomaAntibodyEnhancerMyeloma proteinBiologyBreakpointMalignancyImmunoglobulin heavy chainCancer researchLocus (genetics)ImmunologyGeneticsTranscription factorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Multiple myeloma is a malignancy of antibody-secreting plasma cells. Most patients benefit from current therapies, however, 20% of patients relapse or die within two years and are deemed high risk. Here we analyze structural variants from 795 newly-diagnosed patients as part of the CoMMpass study. We report translocations involving the immunoglobulin lambda (IgL) locus are present in 10% of patients, and indicative of poor prognosis. This is particularly true for IgL-MYC translocations, which coincide with focal amplifications of enhancers at both loci. Importantly, 78% of IgL-MYC translocations co-occur with hyperdiploid disease, a marker of standard risk, suggesting that IgL-MYC-translocated myeloma is being misclassified. Patients with IgL-translocations fail to benefit from IMiDs, which target IKZF1, a transcription factor that binds the IgL enhancer at some of the highest levels in the myeloma epigenome. These data implicate IgL translocation as a driver of poor prognosis which may be due to IMiD resistance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,133
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,331
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations157
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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