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Enregistrement W2952408556 · doi:10.1016/j.vaccine.2019.06.011

Can routinely collected laboratory and health administrative data be used to assess influenza vaccine effectiveness? Assessing the validity of the Flu and Other Respiratory Viruses Research (FOREVER) Cohort

2019· article· en· W2952408556 sur OpenAlexafffund
Jeffrey C. Kwong, Sarah A. Buchan, Hannah Chung, Michael A. Campitelli, Kevin L. Schwartz, Natasha S. Crowcroft, Michael L. Jackson, Timothy Karnauchow, Kevin Katz, Allison McGeer, James Dayre McNally, David Richardson, Susan E. Richardson, Laura C. Rosella, Andrew E. Simor, Marek Smieja, George Zahariadis, Aaron Campigotto, Jonathan B. Gubbay

Notice bibliographique

RevueVaccine · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfluenza Virus Research Studies
Établissements canadiensNewfoundland and Labrador Centre for Applied Health ResearchLondon Health Sciences CentreMcMaster UniversityUniversity Health NetworkHealth Sciences CentrePublic Health OntarioWilliam Osler Health SystemSunnybrook Health Science CentreSinai Health SystemNorth York General HospitalUniversity of OttawaHospital for Sick ChildrenSt. John’s Health Sciences CentreUniversity of TorontoChildren's Hospital of Eastern Ontario
Organismes subventionnairesInstitut canadien d'information sur la santéCanadian Institutes of Health ResearchPublic Health OntarioH2020 HealthOntario Ministry of Health and Long-Term CareCancer Care Ontario
Mots-clésMedicineInfluenza vaccineInfluenza-like illnessConfidence intervalOdds ratioCohort studyCohortSelection biasOddsInfluenza A virusOrthomyxoviridaeVaccinationDemographyInternal medicineImmunologyLogistic regressionVirusPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Linking data on laboratory specimens collected during clinical practice with health administrative data permits highly powered vaccine effectiveness (VE) studies to be conducted at relatively low cost, but bias from using convenience samples is a concern. We evaluated the validity of using such data for estimating VE. METHODS: We created the Flu and Other Respiratory Viruses Research (FOREVER) Cohort by linking individual-level data on respiratory virus laboratory tests, hospitalizations, emergency department visits, and physician services. For community-dwelling adults aged > 65 years, we assessed the presence and magnitude of information and selection biases, generated VE estimates under various conditions, and compared our VE estimates with those from other studies. RESULTS: We included 65,648 unique testing episodes obtained from 54,434 individuals during the 2010-11 to 2015-16 influenza seasons. To examine information bias, we found the proportion testing positive for influenza for patients with unknown interval from illness onset to specimen collection was more similar to patients for whom illness onset date was ≤ 7 days before specimen collection than to patients for whom illness onset was > 7 days before specimen collection. To assess the presence of selection bias, we found the likelihood of influenza testing was comparable between vaccinated and unvaccinated individuals, although the adjusted odds ratios were significantly greater than 1 for some healthcare settings and during some influenza seasons. Over 6 seasons, VE estimates ranged between 36% (95%CI, 27-44%) in 2010-11 and 5% (95%CI, -2, 11%) in 2014-15. VE estimates were similar under a range of conditions, but were consistently higher when accounting for misclassification of vaccination status through a quantitative sensitivity analysis. VE estimates from the FOREVER Cohort were comparable to those from other studies. CONCLUSIONS: Routinely collected laboratory and health administrative data contained in the FOREVER Cohort can be used to estimate influenza VE in community-dwelling older adults.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,010
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,030
Score d'incertitude au seuil0,772

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0100,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,548
Tête enseignante GPT0,545
Écart entre enseignants0,004 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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