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Enregistrement W2952423999 · doi:10.1074/jbc.ra119.007997

Trace levels of peptidoglycan in serum underlie the NOD-dependent cytokine response to endoplasmic reticulum stress

2019· article· en· W2952423999 sur OpenAlexafffund
Raphael Molinaro, Tapas Mukherjee, Robert Flick, Dana J. Philpott, Stephen E. Girardin

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClostridium difficile and Clostridium perfringens research
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCrohn's and Colitis CanadaGovernment of Canada
Mots-clésThapsigarginEndoplasmic reticulumCell biologyNodExtracellularBiologyPeptidoglycanSignal transductionTunicamycinCalcium in biologyUnfolded protein responseIntracellularBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

NOD1 and NOD2 are intracellular sensors of bacterial peptidoglycan that belong to the Nod-like receptor family of innate immune proteins. In addition to their role as direct bacterial sensors, it was proposed that the nucleotide-binding oligomerization domain (NOD) proteins could detect endoplasmic reticulum (ER) stress induced by thapsigargin, an inhibitor of the sarcoplasmic or endoplasmic reticulum calcium ATPase family that pumps Ca 2+ into the ER, resulting in pro-inflammatory signaling. Here, we confirm that thapsigargin induces NOD-dependent pro-inflammatory signaling in epithelial cells. However, the effect was specific to thapsigargin, as tunicamycin and the subtilase cytotoxin SubAB from Shiga toxigenic Escherichia coli , which induce ER stress by other mechanisms, did not induce cytokine expression. The calcium ionophore A23187 also induced NOD-dependent signaling, and calcium chelators demonstrated a role for both intracellular and extracellular calcium in mediating thapsigargin-induced and NOD-dependent pro-inflammatory signaling, in part through the activation of plasma membrane-associated calcium release-activated channels. Moreover, our results demonstrate that both endocytosis and the addition of serum to the cell culture medium were required for thapsigargin-mediated NOD activation. Finally, we analyzed cell culture grade fetal calf serum as well as serum from laboratory mice using HPLC and MS identified the presence of various peptidoglycan fragments. We propose that cellular perturbations that affect intracellular Ca 2+ can trigger internalization of peptidoglycan trace contaminants found in culture serum, thereby stimulating pro-inflammatory signaling. The presence of peptidoglycan in animal serum suggests that a homeostatic function of NOD signaling may have been previously overlooked.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,045
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations51
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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