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Enregistrement W2952479935 · doi:10.1186/s12958-019-0490-y

Identification of potential metabolic biomarkers of polycystic ovary syndrome in follicular fluid by SWATH mass spectrometry

2019· article· en· W2952479935 sur OpenAlexaff
Zhen‐Gao Sun, Hsun‐Ming Chang, Aijuan Wang, Jing‐Yan Song, Xingxing Zhang, Jiayin Guo, Peter C. K. Leung, Fang Lian

Notice bibliographique

RevueReproductive Biology and Endocrinology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPolycystic ovaryFollicular fluidInternal medicineEndocrinologyFollicular phaseInsulin resistanceBiologyMetabolomicsInsulinMedicineBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Polycystic ovary syndrome (PCOS) is a complex disorder associated with multiple metabolic disturbance, including defective glucose metabolism and insulin resistance. The altered metabolites caused by the related metabolic disturbance may affect ovarian follicles, which can be reflected in follicular fluid composition. The aim of this study is to investigate follicular fluid metabolic profiles in women with PCOS using an advanced sequential window acquisition of all theoretical fragment-ion spectra (SWATH) mass spectrometry. MATERIALS AND METHODS: Nineteen women with PCOS and twenty-one healthy controls undergoing IVF/ET were recruited, and their follicular fluid samples were collected for metabolomic study. Follicular fluid metabolic profiles, including steroid hormones, free fatty acids, bioactive lipids, and amino acids were analyzed using the principal component analysis (PCA) and partial least squares to latent structure-discriminant analysis (PLS-DA) model. RESULTS: Levels of free fatty acids, 3-hydroxynonanoyl carnitine and eicosapentaenoic acid were significantly increased (P < 0.05), whereas those of bioactive lipids, lysophosphatidylcholines (LysoPC) (16:0), phytosphingosine, LysoPC (14:0) and LysoPC (18:0) were significantly decreased in women with PCOS (P < 0.05). Additionally, levels of steroid hormone deoxycorticosterone and two amino acids, phenylalanine and leucine were higher in the PCOS patients (P < 0.05). CONCLUSION: Women with PCOS display unique metabolic profiles in their follicular fluid, and this data may provide us with important biochemical information and metabolic signatures that enable a better understanding of the pathogenesis of PCOS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations69
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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