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Enregistrement W2952564037 · doi:10.3389/fneur.2019.00434

Diagnostic Yield and Treatment Impact of Targeted Exome Sequencing in Early-Onset Epilepsy

2019· article· en· W2952564037 sur OpenAlex
Michelle Demos, Ilaria Guella, C DeGuzman, Marna B. McKenzie, Sarah E. Buerki, Daniel M. Evans, Eric Toyota, Cyrus Boelman, Linda Huh, Anita Datta, Aspasia Michoulas, Kathryn Selby, Bruce Björnson, Gabriella Horváth, Elena Lopez‐Rangel, Clara van Karnebeek, Ramona Salvarinova, Erin Slade, Patrice Eydoux, Shelin Adam, Margot I. Van Allen, Tanya N. Nelson, Corneliu Bolbocean, Mary Connolly, Matthew J. Farrer

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Neurology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Rare Diseases
Établissements canadiensCentre for Addiction and Mental HealthUniversity of British ColumbiaBC Children's Hospital
Organismes subventionnairesAlva FoundationRare Disease FoundationBC Children's HospitalChildren's Hospital Foundation
Mots-clésEpilepsyExome sequencingMedicineYield (engineering)ExomeClinical neurologyNeuroscienceBiologyGeneticsPsychiatryMutationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Targeted whole-exome sequencing (WES) is a powerful diagnostic tool for a broad spectrum of heterogeneous neurological disorders. Here, we aim to examine the impact on diagnosis, treatment and cost with early use of targeted WES in early-onset epilepsy. WES was performed on 180 patients with early-onset epilepsy (≤5 years) of unknown cause. Patients were classified as Retrospective (epilepsy diagnosis >6 months) or Prospective (epilepsy diagnosis <6 months). WES was performed on an Ion Proton™ and variant reporting was restricted to the sequences of 620 known epilepsy genes. Diagnostic yield and time to diagnosis were calculated. An analysis of cost and impact on treatment was also performed. A molecular diagnoses (pathogenic/likely pathogenic variants) was achieved in 59/180 patients (33%). Clinical management changed following WES findings in 23 of 59 diagnosed patients (39%) or 13% of all patients. A possible diagnosis was identified in 21 additional patients (12%) for whom supporting evidence is pending. Time from epilepsy onset to a genetic diagnosis was faster when WES was performed early in the diagnostic process (mean: 145 days Prospective vs. 2,882 days Retrospective). Costs of prior negative tests averaged $8,344 per patient in the Retrospective group, suggesting savings of $5,110 per patient using WES. These results highlight the diagnostic yield, clinical utility and potential cost-effectiveness of using targeted WES early in the diagnostic workup of patients with unexplained early-onset epilepsy. The costs and clinical benefits are likely to continue to improve. Advances in precision medicine and further studies regarding impact on long-term clinical outcome will be important.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,434

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle