MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2952702384 · doi:10.1038/s41598-018-37300-4

MultiLink Analysis: Brain Network Comparison via Sparse Connectivity Analysis

2019· article· en· W2952702384 sur OpenAlexfundno aff
Alessandro Crimi, Luca Giancardo, Fabio Sambataro, Alessandro Gozzi, Vittorio Murino, Diego Sona

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthGenentechIXICOH. Lundbeck A/SServierEisaiNorthern California Institute for Research and EducationBioClinicaF. Hoffmann-La RocheUniversity of Southern CaliforniaBiogenU.S. Department of DefenseMeso Scale DiagnosticsAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeNovartis Pharmaceuticals CorporationPfizerEli Lilly and CompanyBristol-Myers SquibbNational Institute on AgingAlzheimer's AssociationFoundation for the National Institutes of Health
Mots-clésComputer scienceNetwork analysisArtificial intelligenceComputational biologyPattern recognition (psychology)Biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The analysis of the brain from a connectivity perspective is revealing novel insights into brain structure and function. Discovery is, however, hindered by the lack of prior knowledge used to make hypotheses. Additionally, exploratory data analysis is made complex by the high dimensionality of data. Indeed, to assess the effect of pathological states on brain networks, neuroscientists are often required to evaluate experimental effects in case-control studies, with hundreds of thousands of connections. In this paper, we propose an approach to identify the multivariate relationships in brain connections that characterize two distinct groups, hence permitting the investigators to immediately discover the subnetworks that contain information about the differences between experimental groups. In particular, we are interested in data discovery related to connectomics, where the connections that characterize differences between two groups of subjects are found. Nevertheless, those connections do not necessarily maximize the accuracy in classification since this does not guarantee reliable interpretation of specific differences between groups. In practice, our method exploits recent machine learning techniques employing sparsity to deal with weighted networks describing the whole-brain macro connectivity. We evaluated our technique on functional and structural connectomes from human and murine brain data. In our experiments, we automatically identified disease-relevant connections in datasets with supervised and unsupervised anatomy-driven parcellation approaches and by using high-dimensional datasets.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,015
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,015
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0070,003
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueScientific Reports→Même sujetFunctional Brain Connectivity Studies→Travaux en français237 207→