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Enregistrement W2952713912 · doi:10.1002/chin.200336187

Development of Quantitative Structure—Activity Relationships and Classification Models for Anticonvulsant Activity of Hydantoin Analogues.

2003· article· en· W2952713912 sur OpenAlexaffabout
Jeffrey J. Sutherland, Donald F. Weaver

Notice bibliographique

RevueChemInform · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueInorganic and Organometallic Chemistry
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNova scotiaCitationChemistryLibrary scienceInformation retrievalPsychologyComputer scienceArchaeologyHistory

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Classification and QSAR analysis was performed on a large set of hydantoin derivatives with measured\nanticonvulsant activity in mice and rats. The classification set comprised 287 hydantoins having maximal\nelectroshock (MES) activity expressed in qualitative form. A subset of 94 hydantoins with MES ED<sub>50</sub> values\nwas used for QSAR analysis. Numerical descriptors were generated to encode topological, geometric/structural,\nelectronic, and thermodynamic properties of molecules. Analyses were performed with training and test\nsets of diverse compounds selected using their representation in a principal component space. Cell- and\ndistance metric-based selection methods were employed in this process. For QSAR, a genetic algorithm\n(GA) was used for selecting subsets of 5−9 descriptors that minimize the rms error on the training sets. The\nmost predictive models have rms errors of 0.86 (<i>r</i><sup>2</sup> = 0.64) and 0.73 (<i>r</i><sup>2</sup> = 0.75) ln(1/ED<sub>50</sub>) units on the\ncell- and distance metric-derived test sets, respectively, and showed convergence in the selected descriptors.\nClassification models were developed using recursive partitioning (RP) and spline-fitting with a GA (SFGA),\na novel method we have implemented. The most predictive RP and SFGA models have classification rates\nof 75% and 80% on the test sets; both methods produced models with similar discriminating features. For\nQSAR and classification, consensus schemes gave improved predictive accuracy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,040
Score d'incertitude au seuil0,646

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,066
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2003
Routes d'admission2
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