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Enregistrement W2952776165 · doi:10.1177/1352458519851428

A pharmacogenetic study implicates <i>NINJ2</i> in the response to Interferon-β in multiple sclerosis

2019· review· en· W2952776165 sur OpenAlexaff
Silvia Peroni, Melissa Sorosina, Sunny Malhotra, Ferdinando Clarelli, Ana Maria Osiceanu, Laura Ferrè, Tina Roostaei, Jordi Río, Luciana Midaglia, Luisa María Villar, José C. Álvarez‐Cermeño, Clara Guaschino, Marta Radaelli, Lorena Citterio, Jeannette Lechner‐Scott, Nino Spataro, Arcadi Navarro, Vittorio Martinelli, Xavier Montalbán, Howard L. Weiner, Philip L. De Jager, Gıancarlo Comı, Federica Esposito, Manuel Comabella, Filippo Martinelli Boneschi

Notice bibliographique

RevueMultiple Sclerosis Journal · 2019
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMultiple Sclerosis Research Studies
Établissements canadiensSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesEuropean Social FundMinisterio de Economía y CompetitividadFondazione Italiana Sclerosi Multipla
Mots-clésMultiple sclerosisPharmacogeneticsInterferonImmunologyMedicineBiomarkerGene expressionGeneInternal medicineOncologyGenotypeBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Multiple sclerosis (MS) is a disease in which biomarker identification is fundamental to predict response to treatments and to deliver the optimal drug to patients. We previously found an association between rs7298096, a polymorphism upstream to the NINJ2 gene, and the 4-year response to interferon-β (IFNβ) treatment in MS patients. Objectives: To analyse the association between rs7298096 and time to first relapse (TTFR) during IFNβ therapy in MS patients and to better investigate its functional role. Methods: Survival analysis was applied in three MS cohorts from different countries ( n = 1004). We also studied the role of the polymorphism on gene expression using GTEx portal and a luciferase assay. We interrogated GEO datasets to explore the relationship between NINJ2 expression, IFNβ and TTFR. Results: Rs7298096 AA patients show a shorter TTFR than rs7298096 G -carriers (P meta-analysis = 3 × 10 −4 , hazard ratio = 1.41). Moreover, rs7298096 AA is associated with a higher NINJ2 expression in blood ( p = 7.0 × 10 −6 ), which was confirmed in vitro ( p = 0.009). Finally, NINJ2 expression is downregulated by IFNβ treatment and related to TTFR. Conclusions: Rs7298096 could influence MS disease activity during IFNβ treatment by modulating NINJ2 expression in blood. The gene encodes for an adhesion molecule involved in inflammation and endothelial cells activation, supporting its role in MS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,010
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesMéta-épidémiologie (sens strict)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,910
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0100,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,002
Bibliométrie0,0030,004
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0030,001
Intégrité de la recherche0,0010,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,385
Tête enseignante GPT0,420
Écart entre enseignants0,035 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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