Prediction of Biopharmaceutical Drug Disposition Classification System (BDDCS) by Structural Parameters
Notice bibliographique
Résumé
Modeling of physicochemical and pharmacokinetic properties is important for the prediction and mechanism characterization in drug discovery and development. Biopharmaceutics Drug Disposition Classification System (BDDCS) is a four-class system based on solubility and metabolism. This system is employed to delineate the role of transporters in pharmacokinetics and their interaction with metabolizing enzymes. It further anticipates drug disposition and potential drug-drug interactions in the liver and intestine. According to BDDCS, drugs are classified into four groups in terms of the extent of metabolism and solubility (high and low). In this study, structural parameters of drugs were used to develop classification-based models for the prediction of BDDCS class. Reported BDDCS data of drugs were collected from the literature, and structural descriptors (Abraham solvation parameters and octanol-water partition coefficient (log P)) were calculated by ACD/Labs software. Data were divided into training and test sets. Classification-based models were then used to predict the class of each drug in BDDCS system using structural parameters and the validity of the established models was evaluated by an external test set. The results of this study showed that log P and Abraham solvation parameters are able to predict the class of solubility and metabolism in BDDCS system with good accuracy. Based on the developed methods for prediction solubility and metabolism class, BDDCS could be predicted in the correct with an acceptable accuracy. Structural properties of drugs, i.e. logP and Abraham solvation parameters (polarizability, hydrogen bonding acidity and basicity), are capable of estimating the class of solubility and metabolism with an acceptable accuracy.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».