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Enregistrement W2952821043 · doi:10.1097/01.hs9.0000562176.15402.a3

PS968 GENETIC LANDSCAPE OF FLT3‐MUTATED ACUTE MYELOID LEUKEMIA (AML) PATIENTS TREATED WITHIN THE RATIFY TRIAL: CALGB 10603 (ALLIANCE)

2019· article· en· W2952821043 sur OpenAlexaff
Nikolaus Jahn, Ekaterina Panina, Lars Bullinger, Anna Dolnik, Julia Herzig, Tamara J. Blätte, Axel Benner, Agnes Gambietz, Julia Krzykalla, Insa Gathmann, Richard A. Larson, Filippo Lococo, Sergio Amadori, Thomas W. Prior, Joseph Brandwein, F R Appelbaum, Bruno C. Medeiros, Martin S. Tallman, Eva Tiecke, Céline Pallaud, G. Ehninger, Michael Heuser, Arnold Ganser, Richard M. Stone, Christian Thiede, Hartmut Döhner, Clara D. Bloomfield, Konstanze Döhner

Notice bibliographique

RevueHemaSphere · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMidostaurinCEBPANPM1OncologyNeuroblastoma RAS viral oncogene homologMedicineInternal medicineAlectinibSanger sequencingMyeloid leukemiaCancer researchKRASMutationBiologyGeneticsGeneCancerCrizotinibKaryotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Recently, the oral multi‐targeted FLT3 inhibitor midostaurin (M) was approved in combination with standard chemotherapy for treatment of FLT3 mutated (FLT3 mut) AML. In the international RATIFY (NCT00651261) trial, M significantly improved overall (OS) and event‐free survival (EFS) compared to placebo, thus defining a new standard of care in this AML subset (Stone RM et al. NEJM 2017). Aims: To comprehensively delineate the mutational profile of FLT3 mut AML patients (pts) treated within the RATIFY trial and to correlate genetic findings with clinical outcome. Methods: Targeted sequencing was performed of 262 candidate genes including 20 kinases targeted by M (M kinome, MK) using SureSelectXT (Agilent). Diagnostic specimens were available from 475 (66%) of 717 FLT3 mut pts. Sequencing was carried out on a HiSeq (Illumina). FLT3 mutation (mut) status was available for all 475 pts [tyrosine kinase domain (TKD: 24%); internal tandem duplication (ITD: 76%)]; cytogenetic data were present for 371 pts (78%). Results: Overall, 1813 mut were identified (median coverage: 978x) with an average of 3.8 mut per pt (FLT3 strata; TKD: 3.9; ITD: 3.8). Mut ≥5% were found for NPM1 (61%), DNMT3A (39%), WT1 (21%), TET2 (12%), RUNX1 (11%), NRAS (11%), PTPN11 (9%), ASXL1 (8%), IDH1 (8%), IDH2 (7%; #R140 only), and SMC1A (6%). In contrast, MK mut were rare events (7% in total) with KIT (2%), MAP3K11 (1%), and NTRK3 (1%) being most frequently mutated. First, we categorized all pts to the recently defined 11 genomic AML classes (Papaemmanuil E et al. NEJM 2016). The majority of cases fell into two classes, namely the NPM1 (N; 60%), and the chromatin‐spliceosome (C‐S; 15%) classes. Core‐binding factor (CBF) AML [t(8;21) and inv(16)] accounted for 4% only; in 13% no class‐defining lesion was identified (no class, NC). In terms of clinical outcome, CBF and N classes showed better response to induction therapy than C‐S and NC (Complete remission (CR) rate: 83%, 70%, 60%, 38%; p = .0005), which translated into significantly superior OS (p < .0001) and EFS (p < .0001) for CBF and N compared to C‐S and NC. When stratified according to treatment arm, addition of M resulted in improved OS in N, C‐S, as well as NC, irrespective of the genetic background. Next, we categorized pts according to the 2017 European LeukemiaNet (ELN) genetic risk groups (Döhner H et al. Blood 2017). CR rate was inferior within the adverse (ADV) and intermediate (INT) as compared to the favorable (FAV) risk group (52%, 62%, 74%; p = .002) translating into significantly shorter EFS (p < .0001) and OS (p < .0001) in INT and ADV than FAV. Of note, M showed consistent beneficial effects across all ELN risk groups. When comparing pts with MK gene mut vs. pts with wildtype MK, no differences in outcome were observed. Within the group of MK mut pts there was no benefit for M; however, the results have to be interpreted cautiously due to the small sample size. Summary/Conclusion: In this comprehensive targeted sequencing approach of 475 FLT3 mut AML pts treated within the RATIFY trial, remarkable differences in the underlying AML genomic classes were found. Predominant classes were N, C‐S, CBF, showing significant differences with regard to response to treatment and survival. Of note, treatment with M showed beneficial effects across all genomic AML classes. In addition, M was associated with a better outcome in all 2017 ELN risk categories, demonstrating a consistent benefit of M across various genetic AML subgroups. Support: U10CA180821, ‐ U10CA180882, U24CA196171; Novartis; https://acknowledgments.alliancefound.org

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
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