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Enregistrement W2953162362 · doi:10.1139/cjb-2019-0043

A new species of penzigioid <i>Xylaria</i> (Xylariaceae) from the cloud forest in eastern Mexico revealed through morphological and phylogenetic analyses

2019· article· en· W2953162362 sur OpenAlexvenueno aff
Santiago Chacón, Dolores González

Notice bibliographique

RevueBotany · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPhylogenetic treeMaximum parsimonyLineage (genetic)GenusCloud forestBotanyPhylogeneticsEvolutionary biologyObligateEcologyCladeGeneticsMontane ecology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Xylaria subtropicalis, a species new to science, was collected from a montane cloud forest in eastern Mexico. It is described and illustrated, based on detailed macro- and microscopic morphological characteristics, habitat, and DNA sequence data. The distinctive morphological differences between X. subtropicalis and other Xylaria species include: the stromata being significantly erumpent, the size of the ascospores being 23–28 μm × 13–15 μm, and a straight germ slit as long as the spore. To determine whether this was a novel species, ITS sequences were generated and compared with 2478 sequences available for the genus from GenBank, using the software USEARCH. Additionally, a phylogenetic reconstruction was performed with Parsimony Ratchet, Maximum Likelihood, and Bayesian Inference, using 122 concatenated ITS sequences, and segments from the 28S rDNA and RPB2. Sequences of this novel species form a strongly supported lineage, clearly separated from other species of Xylaria. Phylogenetic relationships indicate that there have been numerous morphological transformations within the genus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,611
Score d'incertitude au seuil0,452

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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