MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2953281900 · doi:10.1039/c9cp01651a

The K<sub>2</sub>(9-ethylguanine)<sub>12</sub><sup>2+</sup> quadruplex is more stable to unimolecular dissociation than the K(9-ethylguanine)<sub>8</sub><sup>+</sup> quadruplex in the gas phase: a BIRD, energy resolved SORI-CID, IRMPD spectroscopic, and computational study

2019· article· en· W2953281900 sur OpenAlexafffund
Mohammad Azargun, Paul Meister, James W. Gauld, Travis D. Fridgen

Notice bibliographique

RevuePhysical Chemistry Chemical Physics · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA and Nucleic Acid Chemistry
Établissements canadiensUniversity of WindsorMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésChemistryDissociation (chemistry)CrystallographyPhysical chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A combination of experimental trapped-ion mass spectrometric studies and computational chemistry has been used in the present work to assess the intrinsic properties of the potassiated 9-ethylguanine (9eG) self-assembled quadruplex, K2(9eG)122+, in the gas phase. Infrared multiple photon dissociation (IRMPD) spectroscopy in the N-H/C-H stretching region (2700-3800 cm-1) revealed that this G-quadruplex is a sandwich-type structure with two G-tetrads sandwiching each of the two K+, very similar to the structure determined previously for the K(9eG)8+ complexes. The stability of K2(9eG)122+ toward unimolecular dissociation and its binding energy were examined using energy-resolved sustained off-resonance collision induced dissociation (SORI-CID) and blackbody infrared radiative dissociation (BIRD) kinetics experiments. SORI-CID experiments showed that the self-assembled K2(9eG)122+ complex undergoes charge separation forming K(9eG)8+ and K(9eG)4+ compared to K(9eG)8+ which loses neutral 9eG. More interestingly, K2(9eG)122+ is more stable toward unimolecular dissociation activated by SORI-CID than the K(9eG)8+ complex. Temperature dependent BIRD kinetics for K2(9eG)122+ were consistent with energy-resolved SORI-CID results showing K2(9eG)122+ to have an activation energy of 225 ± 15 kJ mol-1, approximately 50 kJ mol-1 greater than that determined for K(9eG)8+. The extra stability of K2(9eG)122+ is apparently not thermodynamic stability, but most likely due to an energy barrier for dissociation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePhysical Chemistry Chemical PhysicsMême sujetDNA and Nucleic Acid ChemistryTravaux en français237 207