SaO014ALLOGRAFT GENE EXPRESSION ASSESSMENT PREDICTS GRAFT LOSS IN KIDNEY RECIPIENTS WITH CHRONIC ANTIBODY-MEDIATED REJECTION
Notice bibliographique
Résumé
INTRODUCTION: Chronic antibody-mediated rejection (cAMR) is a major contributor to kidney allograft loss. However, prognostic heterogeneity has not been addressed. We investigated whether mechanistically-informed prediction of allograft loss could identify patients with different outcomes. METHODS: We prospectively enrolled all adult kidney recipients from two centers at the time of the first post-transplant allograft biopsy showing cAMR according to Banff criteria (2005-2016). All patients were assessed for cAMR phenotype based on histology, immunochemistry and gene expression using Nanostring technology on formalin-fixed paraffin-embedded tissue for 209 pathogenesis-selected genes previously identified for their relevance to transplant diagnosis. All patients underwent anti-HLA antibody, GFR and proteinuria evaluation at the time of cAMR diagnosis, and were followed up to September 2018. RESULTS: Among 151 patients meeting inclusion criteria, cAMR was diagnosed at a median time of 23 (IQR, 10-58) months after transplantation Cross-validated supervised principal component analysis identified two independent linear combinations of 20 genes associated with allograft loss, which were mainly related to B cell immunity and immunoglobulin-mediated immune response. We built a prognostic gene score based on the two components that exhibited good optimism-corrected calibration and greater time-dependent accuracy (5-year AUC of 0.80) than clinical and histological parameters for predicting allograft loss (5-year AUC for GFR, proteinuria and cg score: 0.67, 0.70 and 0.65, respectively). The prognostic gene score identified three groups of patients: low-score patients (n=22) with a 5-year allograft survival of 95%, intermediate-score patients (n=65) with a 5-year allograft survival of 64% and high-score patients (n=64) with a 5-year graft survival of 29% (p<0.001). In multivariable analysis, the prognostic gene score predicted graft loss independently of clinical, immunological and histological parameters (adjusted HR: 1.70, 95%CI: 1.22-2.36, p=0.002). CONCLUSIONS: By addressing prognostic heterogeneity in cAMR at the molecular level, we defined a pathogenesis-based prognostic score that outperformed clinical, immunological and histological parameters for predicting kidney allograft loss.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».