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Enregistrement W2953585553 · doi:10.1101/687418

<i>Macrobdella decora</i> : Old World Leech Gut Microbial Community Structure Conserved in a New World Leech

2019· preprint· en· W2953585553 sur OpenAlex
Emily Ann McClure, Michael C. Nelson, Amy Lin, Joerg Graf

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLeech Biology and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of ConnecticutNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésLeechBiologyMicrobiomeAnnelidEcologySymbiosisZoologyGut floraBacteriaBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Leeches are found in terrestrial, aquatic, and marine habitats on all continents. Sanguivorous leeches have been used in medicine for millennia. Modern scientific uses include studies of neurons, anticoagulants, and gut microbial symbioses. Hirudo verbana , the European medicinal leech, maintains a gut community dominated by two bacterial symbionts, Aeromonas veronii and Mucinivorans hirudinis , which sometimes account for as much as 97% of the total crop microbiota. The highly simplified gut anatomy and microbiome of H. verbana make it an excellent model organism for studying gut microbial dynamics. The North American medicinal leech, Macrobdella decora, is a hirudinid leech native to Canada and the northern U.S.A. In this study we show that M. decora symbiont communities are very similar to those in H. verbana. This similarity allowed for an extensive study in which wild caught animals were sampled to determine effects of geographic separation, time of collection, and feeding on the microbiome. Through 16S V4 rRNA deep sequencing we show that: i) the M. decora gut and bladder microbial communities are distinct, ii) the M. decora gut community is affected by feeding and long periods of starvation, and iii) geographic separation does not appear to affect the overall gut microbial community structure. We propose that M. decora is a replacement for H. verbana for studies of wild-caught animals and offer evidence for the conservation of annelid symbionts. Successful culturing and comparison of dominant symbionts from M. decora and H. verbena will provide the ability to assess host-symbiont co-evolution in future work. IMPORTANCE Building evidence implicates the gut microbiome in regulating animal digestion, nutritional acquisition, immune regulation, development, and even mood regulation. Because of the difficulty of assigning causative relationships in complex gut microbiomes a simplified model for testing hypotheses is necessary. Previous research in Hirudo verbana has suggested this animal as a highly simplified and tractable animal model of gut symbioses. Our data show that Macrobdella decora may work just as well as H. verbana without the drawback of being an endangered organism and with the added convenience of easy access to field-caught specimens. The similarity of the microbial community structure of species from two different continents reveals the highly-conserved nature of the microbial symbionts in sanguivorous leeches and confirms the medicinal leech as a highly simplified, natural animal model in which to study gut symbioses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,406
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle