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Enregistrement W2953588121 · doi:10.1038/s41598-019-46144-5

A novel motif in the proximal C-terminus of Pannexin 1 regulates cell surface localization

2019· article· en· W2953588121 sur OpenAlexafffund
Anna L. Epp, Sarah N. Ebert, Juan C. Sanchez‐Arias, Leigh E. Wicki‐Stordeur, Andrew K. J. Boyce, Leigh Anne Swayne

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnexins and lens biology
Établissements canadiensUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesBritish Columbia Knowledge Development FundNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMinistry of Technology, Innovation and Citizens' ServicesCanadian Network for Research and Innovation in Machining Technology, Natural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Foundation for InnovationGovernment of CanadaMichael Smith Health Research BCUniversity of Victoria
Mots-clésPannexinMotif (music)Cell biologyN-terminusSequence motifC-terminusComputational biologyBiologyChemistryPeptide sequenceGeneticsAmino acidGap junctionGeneIntracellularArt

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Pannexin 1 (Panx1) ion and metabolite channel is expressed in a wide variety of cells where it regulates a number of cell behaviours including proliferation and differentiation. Panx1 is expressed on the cell surface as well as intracellular membranes. Previous work suggests that a region within the proximal Panx1 C-terminus (Panx1CT) regulates cell surface localization. Here we report the discovery of a putative leucine-rich repeat (LRR) motif in the proximal Panx1CT necessary for Panx1 cell surface expression in HEK293T cells. Deletion of the putative LRR motif results in significant loss of Panx1 cell surface distribution. Outcomes of complementary cell surface oligomerization and glycosylation state analyses were consistent with reduced cell surface expression of Panx1 LRR deletion mutants. Of note, the oligomerization analysis revealed the presence of putative dimers and trimers of Panx1 at the cell surface. Expression of Panx1 increased HEK293T cell growth and reduced doubling time, while expression of a Panx1 LRR deletion mutant (highly conserved segment) did not reproduce this effect. In summary, here we discovered the presence of a putative LRR motif in the Panx1CT that impacts on Panx1 cell surface localization. Overall these findings provide new insights into the molecular mechanisms underlying C-terminal regulation of Panx1 trafficking and raise potential new lines of investigation with respect to Panx1 oligomerization and glycosylation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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