Non-Canonical Regulation of Phosphatidylserine Metabolism by a Phosphatidylinositol Transfer Protein and a Phosphatidylinositol 4-OH Kinase
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT The phosphatidylserine (PtdSer) decarboxylase Psd2 is proposed to engage in an endoplasmic reticulum (ER)-Golgi/endosome membrane contact site (MCS) that facilitates phosphatidylserine decarboxylation to phosphatidylethanomaine (PtdEtn) in Saccharomyces cerevisiae . While this MCS is envisioned to consist of Psd2, the Sec14-like phosphatidylinositol transfer protein (PITP) Sfh4, the Stt4 phosphatidylinositol (PtdIns) 4-OH kinase, the Scs2 tether, and at least one other uncharacterized protein, functional data that address key foundations of this model are sparse. We now report that Psd2, Sfh4 and Stt4 are the only components individually required for biologically sufficient Psd2-dependent PtdEtn production. Surprisingly, neither the PtdIns-transfer activity of Sfh4 nor its capacity to activate Stt4 is required to stimulate the Psd2 pathway. Instead, Sfh4 activates the Psd2 pathway via a specific Sfh4-Psd2 physical interaction. Whereas the data indicate an Sfh4-independent association of Stt4 with Psd2 as well, we find Stt4 also regulates Psd2 activity indirectly by influencing the PtdSer pool accessible to Psd2 for decarboxylation. These collective results demonstrate that the proposed ER-Golgi/endosomal MCS model fails to provide an accurate description of the Psd2 system in yeast, and provide an example where the biological function of a Sec14-like PITP is uncoupled from its ‘canonical’ activity as a PtdIns transfer protein.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».