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Enregistrement W2953910594 · doi:10.1177/0883073819854604

Expanding the Phenotype: Neurodevelopmental Disorder, Mitochondrial, With Abnormal Movements and Lactic Acidosis, With or Without Seizures (NEMMLAS) due to WARS2 Biallelic Variants, Encoding Mitochondrial Tryptophanyl-tRNA Synthase

2019· article· en· W2953910594 sur OpenAlexaff
Manveen Virdee, Eroshini Swarnalingam, Mariya Kozenko, Mark A. Tarnopolsky, Kevin Jones

Notice bibliographique

RevueJournal of Child Neurology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Rare Diseases
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLactic acidosisAtaxiaMitochondrial diseaseCompound heterozygosityExome sequencingNeurodevelopmental disorderHypotoniaMitochondrial myopathyMedicinePathologyBioinformaticsGeneticsBiologyPhenotypeInternal medicineMitochondrial DNAGenePsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: WARS2 encodes a tryptophanyl tRNA synthetase, which is involved in mitochondrial protein synthesis. Biallelic mutations in WARS2 are rare and have been associated with a spectrum of clinical presentations, including neurodevelopmental disorder with abnormal movements, lactic acidosis with or without seizures (NEMMLAS). CASE PRESENTATION: Here we present the case of an 8-year-old girl with ataxia and parkinsonism with periventricular white matter abnormalities on magnetic resonance imaging (MRI) and global developmental delay. The initial investigations revealed an elevated lactate level. Extensive metabolic testing, including a muscle biopsy, was inconclusive. Cerebrospinal fluid (CSF) neurotransmitter levels were low; however, a trial of levodopa was unremarkable. The chromosomal microarray and initial ataxia gene panel was normal. Zinc supplementation for a heterozygous variant of unknown significance in the CP gene on the ataxia exome panel was not effective in treating her symptoms. Reanalysis of the ataxia exome panel highlighted biallelic mutations in WARS2, which lead to the diagnosis of neurodevelopmental disorder, mitochondrial, with abnormal movements and lactic acidosis, with or without seizures (NEMMLAS). This lead to parental genetic testing, redirected therapy, and helped to expand the symptomology of this rare condition. CONCLUSION: Here we emphasize the importance of imminent and repeat expanded genetic testing to ensure early diagnosis and treatment for rare pediatric disorders. The patient is being trialed on a mitochondrial cocktail in an attempt to compensate for defects in mitochondrial protein synthesis associated with this variant. Longitudinal monitoring of disease manifestation will help establish the currently unknown natural history of this condition.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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