Ciliary photoreceptors in sea urchin larvae indicate pan-deuterostome cell type conservation
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT One of the signatures of evolutionarily related cell types is the expression of similar combinations of transcription factors in distantly related animals. Here we present evidence that sea urchin larvae possess bilateral clusters of ciliary photoreceptors that are positioned in the oral/anterior apical neurogenic domain and associated with pigment cells. The expression of synaptotagmin indicates that the photoreceptors are neurons. Immunostaining shows that the sea urchin photoreceptors express an RGR/G O -opsin, opsin3.2, which co-localizes with tubulin on immotile cilia on the cell surface. Furthermore, orthologs of several transcription factors expressed in vertebrate photoreceptors are expressed in sea urchin ciliary photoreceptors, including Otx, Six3, Tbx2/3, and Rx, a transcription factor typically associated with ciliary photoreceptors. Analysis of gene expression during sea urchin development indicates that the photoreceptors derive from the anterior apical neurogenic domain. Thus, based on location, developmental origin, and transcription factor expression, sea urchin ciliary photoreceptors are likely homologous to vertebrate rods and cones. However, we found that genes typically involved in eye development in many animals, including pax6 , six1/2 , eya , and dac , are not expressed in sea urchin ciliary photoreceptors. Instead, all four genes are co-expressed in the hydropore canal, indicating that these genes operate as a module in an unrelated developmental context. Thus, based on current evidence, we conclude that at least within deuterostomes, ciliary photoreceptors share a common evolutionary origin and express a shared regulatory state that includes Rx, Otx, and Six3, but not transcription factors that are commonly associated with the retinal determination circuit.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».