Genome-wide transcript analysis of inflorescence development in wheat
Notice bibliographique
Résumé
The process of inflorescence development is directly related to yield components that determine the final grain yield in most cereal crops. Here, microarray analysis was conducted for four different developmental stages of inflorescence to identify genes expressed specifically during inflorescence development. To select inflorescence-specific expressed genes, we conducted meta-analysis using 1245 Affymetrix GeneChip array sets obtained from various development stages, organs, and tissues of members of Poaceae. The early stage of inflorescence development was accompanied by a significant upregulation of a large number of cell differentiation genes, such as those associated with the cell cycle, cell division, DNA repair, and DNA synthesis. Moreover, key regulatory genes, including the MADS-box gene, KNOTTED-1-like homeobox genes, GROWTH-REGULATING FACTOR 1 gene, and the histone methyltransferase gene, were highly expressed in the early inflorescence development stage. In contrast, fewer genes were expressed in the later stage of inflorescence development, and played roles in hormone biosynthesis and meiosis-associated genes. Our work provides novel information regarding the gene regulatory network of cell division, key genes involved in the differentiation of inflorescence in wheat, and regulation mechanism of inflorescence development that are crucial stages for determining final grain number per spike and the yield potential of wheat.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».