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Enregistrement W2954632147 · doi:10.1503/jpn.180016

An artificial neural network model for clinical score prediction in Alzheimer disease using structural neuroimaging measures

2019· article· en· W2954632147 sur OpenAlexaffvenue
Nikhil Bhagwat, Jon Pipitone, Aristotle N. Voineskos, M. Mallar Chakravarty

Notice bibliographique

RevueJournal of Psychiatry and Neuroscience · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDementia and Cognitive Impairment Research
Établissements canadiensMcGill UniversityDouglas Mental Health University InstituteUniversity of TorontoCentre for Addiction and Mental Health
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental HealthNational Institute on Aging
Mots-clésNeuroimagingAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeAlzheimer's diseaseDiseaseDementiaCorrelationMini–Mental State ExaminationPsychologyMedicineNeuroscienceInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: The development of diagnostic and prognostic tools for Alzheimer disease is complicated by substantial clinical heterogeneity in prodromal stages. Many neuroimaging studies have focused on case–control classification and predicting conversion from mild cognitive impairment to Alzheimer disease, but predicting scores from clinical assessments (such as the Alzheimer’s Disease Assessment Scale or the Mini Mental State Examination) using MRI data has received less attention. Predicting clinical scores can be crucial in providing a nuanced prognosis and inferring symptomatic severity. Methods: We predicted clinical scores at the individual level using a novel anatomically partitioned artificial neural network (APANN) model. The model combined input from 2 structural MRI measures relevant to the neurodegenerative patterns observed in Alzheimer disease: hippocampal segmentations and cortical thickness. We evaluated the performance of the APANN model with 10 rounds of 10-fold cross-validation in 3 experiments, using cohorts from the Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative (ADNI): ADNI1, ADNI2 and ADNI1 + 2. Results: Pearson correlation and root mean square error between the actual and predicted scores on the Alzheimer’s Disease Assessment Scale (ADNI1: r = 0.60; ADNI2: r = 0.68; ADNI1 + 2: r = 0.63) and Mini Mental State Examination (ADNI1: r = 0.52; ADNI2: r = 0.55; ADNI1 + 2: r = 0.55) showed that APANN can accurately infer clinical severity from MRI data. Limitations: To rigorously validate the model, we focused primarily on large cross-sectional baseline data sets with only proof-of-concept longitudinal results. Conclusion: The APANN provides a highly robust and scalable framework for predicting clinical severity at the individual level using high-dimensional, multimodal neuroimaging data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,036

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,142
Tête enseignante GPT0,425
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations48
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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