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Enregistrement W2954855872 · doi:10.1158/1538-7445.sabcs18-2272

Abstract 2272: Exploratory analysis of T cell repertoire dynamics upon systemic treatment with the oncolytic virus pelareorep in combination with pembrolizumab and chemotherapy in patients with advanced pancreatic adenocarcinoma

2019· article· en· W2954855872 sur OpenAlexaff
Grey Wilkinson, Devalingam Mahalingam, Sukeshi Patel Arora, Paul Fields, Patrick Raber, Karol Cheetham, Matt Coffey

Notice bibliographique

RevueClinical Research (Excluding Clinical Trials) · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVirus-based gene therapy research
Établissements canadiensOncolytics Biotech (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPembrolizumabOncolytic virusGemcitabineMedicineChemotherapyCD8IrinotecanCancer researchOncologyImmunotherapyInternal medicineImmune systemImmunologyCancerColorectal cancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Pelareorep is an immuno-oncolytic virus that induces an inflamed tumor phenotype in metastatic adenocarcinoma of the pancreas (MAP). Systemically delivered pelareorep in combination with chemotherapy achieves 1 & 2 year-survival rates of 46% & 24% in MAP pts, respectively. Analysis of tumor tissue from patients (pts) treated with pelareorep, chemotherapy and anti-PD-L1 have shown reovirus RNA and protein replication, T-cell infiltration, and upregulation of PD-L1, highlighting that effective T-cell recognition of tumor antigens may be critical to success for this combination therapy. Thus, we hypothesized that pelareorep in combination with chemo and pembrolizumab in pts with MAP would alter the peripheral T-cell repertoire, creating new T-cell clones via the release of novel neoantigens in addition to expanding existing T-cell clones.Methods: A phase 1b study enrolled 11 MAP pts who progressed after first-line treatment. Pts received pelareorep (4.5e10 TCID 50 IV, D1 & D2), plus pembrolizumab (2mg/kg IV, D8) plus either 1) 5-FU (LV (200 mg/m2 /5-FU 200 mg /m2 IV bolus, 5-FU 1200mg/m2 continuous IV infusion D1) or 2) gemcitabine (1000 mg/m2 IV, D1), or 3) irinotecan (125 mg/m2 IV, D1) q3w, until disease progression/unacceptable toxicity. DNA from peripheral blood mononuclear cells from nine patients at cycle 1 day 1 (C1D1) & C2D1 (approx. 3 weeks later) was analyzed using the immunoSEQ® Assay (Adaptive Biotechnologies, Seattle) sequencing the T-cell receptor beta chain region to interrogate changes in the T-cell repertoire.Results: The median Morisita index between C2D1 and C1D1 was 0.83 with 3 samples below 0.6, indicative of significant peripheral repertoire turnover. The median number of expanded clones equated to 45.7 per 100,000 cumulative templates; normal variation over 4 weeks is ~ 5-10 expanded clones. Strikingly, most (median: 86%) peripheral clonal expansion occurred in clones below the limit of detection at C1D1. Cox regression analysis revealed that high peripheral clonality correlates with progression free survival at C1D1 (p=0.01, HR=0.053). Moreover, high clonality correlates with overall survival at both C1D1 (p=0.013, HR=0.124) and C2D1 (p=0.010, HR=0.079).Conclusions: High levels of peripheral T-cell repertoire turnover occur between C1D1 and C2D1. Repertoire turnover is accompanied by significant clonal expansion, mostly by expansion of new clones (i.e. undetected in C1D1). Higher peripheral clonality is associated with better progression free survival at C1D1, and overall survival at C1D1 and C2D1. This research highlights the potential utility of T-cell clonality as a predictive and prognostic biomarker to pelareorep therapy and warrants further clinical investigation.Citation Format: Grey A. Wilkinson, Devalingam Mahalingam, Sukeshi Patel Arora, Paul A. Fields, Patrick Raber, Karol Cheetham, Matt Coffey. Exploratory analysis of T cell repertoire dynamics upon systemic treatment with the oncolytic virus pelareorep in combination with pembrolizumab and chemotherapy in patients with advanced pancreatic adenocarcinoma [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2019; 2019 Mar 29-Apr 3; Atlanta, GA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2019;79(13 Suppl):Abstract nr 2272.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,018
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,070
Score d'incertitude au seuil0,836

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0180,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,125
Tête enseignante GPT0,451
Écart entre enseignants0,326 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
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