The rich conformational landscape of perillyl alcohol revealed by broadband rotational spectroscopy and theoretical modelling
Notice bibliographique
Résumé
The rotational spectrum of perillyl alcohol, a naturally occurring, chiral, dietary monoterpene, was investigated using a chirped pulse Fourier transform microwave spectrometer and a cavity-based Fourier transform microwave spectrometer. To aid the assignment of the dense chirped pulse spectrum obtained, extensive theoretical conformational searches were carried out. In one approach, several one and two-dimensional scans along three dihedral angles associated with the rotational motions of the -OH, -CH2OH, and -C(CH2)CH3 groups were performed. These scans, combined with the equatorial and axial positions of the -C(CH2)CH3 group, resulted in 54 conformers. The same conformers were identified in the second approach where a semi-classical conformational search code was used. The relative stabilities of the conformers and the interconversion barriers among them were explored extensively at the DFT B3LYP-D3(BJ)/def2-TZVP and B3LYP-D3(BJ)/6-311++G(2d,p), as well as local MP2/aug-cc-pVQZ levels of theory, and 12 conformers were ultimately identified as possibly observable candidates in a molecular jet expansion. Rotational spectra of eight out of the 12 candidates were observed experimentally and analyzed. The non-observation of the remaining four conformers may be attributed to their low abundances. The study points out the importance of identifying all conformers of relevant abundance, even those which could not be detected experimentally, in order to properly benchmark the theoretical relative stabilities with the experimental ones. A comprehensive study of the conformational distribution of perillyl alcohol contributes to our understanding of its structural properties which may influence its functions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».