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Enregistrement W2955055632 · doi:10.1371/journal.pone.0218674

Tumor- and cytokine-primed human natural killer cells exhibit distinct phenotypic and transcriptional signatures

2019· article· en· W2955055632 sur OpenAlexfundno aff
May Sabry, Agnieszka Zubiak, Simon Hood, Poppy Simmonds, Helena Arellano-Ballestero, Eily Cournoyer, Meghavi Mashar, A. Graham Pockley, Mark W. Lowdell

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesJohn and Lucille Van Geest FoundationTrent UniversityNottingham Trent University
Mots-clésNKG2DBiologyNatural killer cellInterleukin 21Lymphokine-activated killer cellCD16CytokineInterleukin 12ChemokineCell biologyImmunologyCancer researchCytotoxic T cellT cellImmune systemCD8CD3In vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An emerging cellular immunotherapy for cancer is based on the cytolytic activity of natural killer (NK) cells against a wide range of tumors. Although in vitro activation, or "priming," of NK cells by exposure to pro-inflammatory cytokines, such as interleukin (IL)-2, has been extensively studied, the biological consequences of NK cell activation in response to target cell interactions have not been thoroughly characterized. We investigated the consequences of co-incubation with K562, CTV-1, Daudi RPMI-8226, and MCF-7 tumor cell lines on the phenotype, cytokine expression profile, and transcriptome of human NK cells. We observe the downregulation of several activation receptors including CD16, CD62L, C-X-C chemokine receptor (CXCR)-4, natural killer group 2 member D (NKG2D), DNAX accessory molecule (DNAM)-1, and NKp46 following tumor-priming. Although this NK cell phenotype is typically associated with NK cell dysfunction in cancer, we reveal the upregulation of NK cell activation markers, such as CD69 and CD25; secretion of pro-inflammatory cytokines, including macrophage inflammatory proteins (MIP-1) α /β and IL-1β/6/8; and overexpression of numerous genes associated with enhanced NK cell cytotoxicity and immunomodulatory functions, such as FAS, TNFSF10, MAPK11, TNF, and IFNG. Thus, it appears that tumor-mediated ligation of receptors on NK cells may induce a primed state which may or may not lead to full triggering of the lytic or cytokine secreting machinery. Key signaling molecules exclusively affected by tumor-priming include MAP2K3, MARCKSL1, STAT5A, and TNFAIP3, which are specifically associated with NK cell cytotoxicity against tumor targets. Collectively, these findings help define the phenotypic and transcriptional signature of NK cells following their encounters with tumor cells, independent of cytokine stimulation, and provide insight into tumor-specific NK cell responses to inform the transition toward harnessing the therapeutic potential of NK cells in cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,137
Score d'incertitude au seuil0,997

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,199
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations48
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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