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Enregistrement W2955080438 · doi:10.1158/1538-7445.sabcs18-4051

Abstract 4051: First step for development of checkpoint inhibitors immune monitoring panels in human whole blood and peripheral mononuclear cells

2019· article· en· W2955080438 sur OpenAlexaff
Laila-Aicha Hanfi, Scott Sugden

Notice bibliographique

RevueImmunology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Immunotherapy and Biomarkers
Établissements canadiensCaprion (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPeripheral blood mononuclear cellImmune systemMonoclonal antibodyFlow cytometryAntibodyclone (Java method)ImmunotherapyImmunologyCD8Cancer immunotherapyMedicineBiologyCancer researchIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cancer immunotherapies represent more than half of treatments approved for oncology, as well as those currently in development. Among the key targets of these therapies are immune-checkpoint molecules (i.e. PD-1, LAG3, PD-L1, CTLA-4). Novel immunotherapies targeting these molecules are designed to impact tumor microenvironment immune-suppression. The characterization and monitoring of circulating and tumor infiltrating immune cells by flow cytometry is a critical aspect of pre-clinical and clinical drug development. In order to generated robust data to support drug development, flow cytometric methods must be fully optimized. In this presentation will discuss the critical aspects of assay optimization for flow cytometric methods with an emphasis on screening monoclonal antibody clones. The importance of the data is illustrated in the differences in assay performance when the correct clones are identified.Methods: Four different anti-PD-1 obtained from different providers were screened on activated human PBMC. Additionally, four PD-L1 and five LAG-3 monoclonal antibody clones were screened on activated or rested PBMC spiked in whole blood. All antibodies were all titrated to obtain saturating concentration and optimal titers of different clones were compared.Results: On CD4+ T cells from thawed cryopreserved peripheral blood mononuclear cells (PBMC), the best performance was observed with EH12.2H7 or EH12.1 clones which identified 30-33% of CD4+ T cells as PD-1 positive and up to 55-60% of CD8+ T cells as PD-1 positive. Clone eBioJ105 staining of the same samples on the same day identified 14% PD-1 positive in CD4+ T cell and around 40% PD-1 positive in CD8+ T cell, while clone MIH4 staining revealed low level of PD-1 expression on CD4+ T cells and CD8+ T cells. After ex vivo stimulation with staphylococcus enterotoxin B (SEB), EH12.2H7, EH12.1 and eBioJ105 clones all yielded similar results with 76-85% PD-1 positive on both CD4+ T cells and CD8+ T cells but fewer positive cells were identified with MIH4 clone.Out of the four PD-L1 antibodies tested, only two were able to distinguish a clear PD-L1 population on PBMC rested for 4 days and spiked in whole blood used as positive control for PD-L1 induction.For LAG-3 antibodies, all five were able to reveal the induction of this checkpoint molecule on cells activated by SEB and spiked in whole blood with % of LAG3+ cells in lymphocytes ranging from 13% to 25%.Conclusions: These results illustrate the importance of thorough reagent evaluation in order to achieve a sensitivity coherent with the information-rich promises of flow cytometry.Citation Format: Laila-Aicha Hanfi, Scott Sugden. First step for development of checkpoint inhibitors immune monitoring panels in human whole blood and peripheral mononuclear cells [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2019; 2019 Mar 29-Apr 3; Atlanta, GA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2019;79(13 Suppl):Abstract nr 4051.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,363
Score d'incertitude au seuil0,661

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
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