Identification and Characterization of S-RNases in Japanese Plum Genotypes
Notice bibliographique
Résumé
Many species of the genus Prunus exhibit the gametophytic self-incompatibility system, governed by the S-locus, that encode S-Ribonucleases in the pistil, and are able to degrade the RNA of the pollen tubes when the S-haplotypes of both gametophytes are the same, preventing the fertilization of the oosphere. The objective of this study was to identify and characterize the S-alleles of Japanese Plum genotypes to verify groups of reproductive compatibility. Isolation, amplification and DNA sequencing were performed to obtain an allelic profile of the genotypes. Combinations of PC1 and PC2 primers identified 95% of the genotypes. After sequencing, the ‘Sc’, ‘Si’, ‘Sa’ and ‘Sh’ alleles were obtained with an identity greater than 90%, compared to the NCBI sequences. PC2 was more extensive in identifying the S-alleles in the S-RNases coding region, generating larger fragments than PC1. In this way, it was possible to generate three groups of genotypes with S-alleles of the same size with PC2: Group 1 (Selection Embrapa A19, Selection Embrapa A28, Black Amber Black, Fortune, Roysum, SC-7 and Zafira); and Group 2: (Selection Embrapa A7, Carazinho, Sanguínea, Laroda, SC-15 and Rebelatto) and Group 3 (Selection Ameixa 86-13, Golden King, Letícia and Robusto). Each primer combination amplified only one allele per genotype, suggesting the development of specific primers to amplify the S-alleles in each genotype. The identification and characterization of the alleles allow the use of genotypes compatible with each other, considering the floral synchrony of the genotypes, besides providing information for the management of the breeding processes in Japanese Plums.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».