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Enregistrement W2955306952 · doi:10.1158/1538-7445.am2019-142

Abstract 142: The EGFR signaling modulates in mesenchymal stem cells the expression of microRNAs involved in the interaction with breast cancer cells

2019· article· en· W2955306952 sur OpenAlexaff
Marianna Gallo, Marianeve Carotenuto, Cristin Roma, Francesca Bergantino, Pasqualino De Antonellis, Nicola Normanno, Antonella De Luca

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related molecular mechanisms research
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésmicroRNAMesenchymal stem cellMicrovesiclesBiologyParacrine signallingCancer researchTranscriptomeEpidermal growth factor receptorBreast cancerExosomeCancerCell biologyMolecular biologyGene expressionGeneReceptorGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction. We previously demonstrated that the activation of the epidermal growth factor receptor (EGFR) in mesenchymal stem cells (MSCs) modulates the expression of a number of genes coding for secreted proteins that promote breast cancer cell progression. As different microRNAs (miRNAs) have been shown to be involved in the cross-talk between MSCs and tumor cells, we hypothesized that the EGFR might regulate in MSCs the expression of miRNAs that might affect breast cancer progression through paracrine circuits. To this aim, we analysed the whole small RNA transcriptome of MSCs stimulated or not with transforming growth factor α (TGFα), one of the main ligands of the EGFR. Materials and methods. Small RNA sequencing was performed using the SOLiD 5500xl System. The DAVID (Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery) database was used for pathway analysis. Exosomes containing miRNAs were isolated from conditioned media with the ExoQuick reagent. MiRNA expression levels in conditioned medium were analyzed by Real Time PCR. Anchorage-dependent growth assays and Boyden-chamber based colorimetric migration assays were used to assess the proliferation and the migration of breast cancer cells, respectively. Results. Following small RNA sequencing, we identified 36 miRNAs differentially expressed between untreated and TGFα-treated MSCs with a fold change (FC) <0.56 or FC ≥1.90 (Confidence Interval, CI, 95%) and a threshold of sequence counts≥150 in at least one sample. In particular, 18 miRNAs resulted up-regulated with FC≥1.90 and 18 miRNAs down-regulated with FC<0.56. Pathways analysis of the target genes of the differentially expressed miRNAs revealed a significant enrichment in different KEGG pathways involved in cancer development and progression, including TGFβ signaling, focal adhesion, Rap1 signaling, Hippo signaling, mTOR and RAS signaling. To study miRNAs involved in the TGFα-mediated interaction between MSCs and breast cancer cells, we collected conditioned media from MSCs and analysed the expression levels of selected miRNAs. Real Time PCR analysis revealed the presence of several miRNAs in the conditioned medium from MSCs, including miR-23c, miR379-3p and miR-432-5p. The biological activity of the identified miRNAs was explored in a panel of breast cancer cell lines. MiR-23c was found to regulate the proliferation and migration of triple negative MDA-MB-468 and MDA-MB-231 breast cancer cells. Conclusion. Collectively, our data suggest that the EGFR signaling regulate in MSCs a wide number of miRNAs that might be involved in breast cancer progression, providing novel information on the mechanisms that regulate the MSC-tumor cross-talk. Citation Format: Marianna Gallo, Marianeve Carotenuto, Cristin Roma, Francesca Bergantino, Pasqualino de Antonellis, Nicola Normanno, Antonella De Luca. The EGFR signaling modulates in mesenchymal stem cells the expression of microRNAs involved in the interaction with breast cancer cells [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2019; 2019 Mar 29-Apr 3; Atlanta, GA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2019;79(13 Suppl):Abstract nr 142.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,327
Écart entre enseignants0,299 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
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