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Enregistrement W2955637065 · doi:10.1371/journal.pmed.1002847

Validation of the prognostic value of NF-κB p65 in prostate cancer: A retrospective study using a large multi-institutional cohort of the Canadian Prostate Cancer Biomarker Network

2019· article· en· W2955637065 sur OpenAlexafffundabout
Andrée‐Anne Grosset, Véronique Ouellet, Christine Caron, Gabriela Fragoso, Véronique Barrès, Nathalie Delvoye, Mathieu Latour, Armen Aprikian, Alain Bergeron, Simone Chevalier, Ladan Fazli, Neil Fleshner, Martin Gleave, Pierre I. Karakiewicz, Louis Lacombe, Jean‐Baptiste Lattouf, Theodorus van der Kwast, Dominique Trudel, Anne‐Marie Mes‐Masson, Fred Saad

Notice bibliographique

RevuePLoS Medicine · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNF-κB Signaling Pathways
Établissements canadiensUniversity Health NetworkUniversité LavalCentre hospitalier de l'Université LavalCentre hospitalier universitaire de QuébecMcGill University Health CentreCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéTerry Fox Research Institute
Mots-clésProstate cancerMedicineProstatectomyTissue microarrayOncologyInternal medicineBiomarkerProportional hazards modelHazard ratioCancerBiochemical recurrenceCohortPathologyBiologyConfidence interval

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The identification of patients with high-risk prostate cancer (PC) is a major challenge for clinicians, and the improvement of current prognostic parameters is an unmet clinical need. We and others have identified an association between the nuclear localization of NF-κB p65 and biochemical recurrence (BCR) in PC in small and/or single-centre cohorts of patients. METHODS AND FINDINGS: In this study, we accessed 2 different multi-centre tissue microarrays (TMAs) representing cohorts of patients (Test-TMA and Validation-TMA series) of the Canadian Prostate Cancer Biomarker Network (CPCBN) to validate the association between p65 nuclear frequency and PC outcomes. Immunohistochemical staining of p65 was performed on the Test-TMA and Validation-TMA series, which include PC tissues from patients treated by first-line radical prostatectomy (n = 250 and n = 1,262, respectively). Two independent observers evaluated the p65 nuclear frequency in digital images of cancer tissue and benign adjacent gland tissue. Kaplan-Meier curves coupled with a log-rank test and univariate and multivariate Cox regression models were used for statistical analyses of continuous values and dichotomized data (cutoff of 3%). Multivariate analysis of the Validation-TMA cohort showed that p65 nuclear frequency in cancer cells was an independent predictor of BCR using continuous (hazard ratio [HR] 1.02 [95% CI 1.00-1.03], p = 0.004) and dichotomized data (HR 1.33 [95% CI 1.09-1.62], p = 0.005). Using a cutoff of 3%, we found that this biomarker was also associated with the development of bone metastases (HR 1.82 [95% CI 1.05-3.16], p = 0.033) and PC-specific mortality (HR 2.63 [95% CI 1.30-5.31], p = 0.004), independent of clinical parameters. BCR-free survival, bone-metastasis-free survival, and PC-specific survival were shorter for patients with higher p65 nuclear frequency (p < 0.005). As the small cores on TMAs are a limitation of the study, a backward validation of whole PC tissue section will be necessary for the implementation of p65 nuclear frequency as a PC biomarker in the clinical workflow. CONCLUSIONS: We report the first study using the pan-Canadian multi-centre cohorts of CPCBN and validate the association between increased frequency of nuclear p65 frequency and a risk of disease progression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,451
Score d'incertitude au seuil0,907

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2019
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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