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Enregistrement W2955657627

Environmental effects on oral biofilm communities

2018· dissertation· en· W2955657627 sur OpenAlex
Monika Naginyte

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueWhite Rose eTheses Online (University of Leeds, The University of Sheffield, University of York) · 2018
Typedissertation
Langueen
DomaineDentistry
ThématiqueOral microbiology and periodontitis research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiofilmFastidious organismSalivaPrevotellaMicrobiologyBiologyActinomycesOral MicrobiomeDysbiosisMicrobiomeMetagenomicsStreptococcus mutansPeriodontitisBacteriaMedicineDentistry
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Periodontitis is associated with shifts in the balance of the microbial composition of subgingival biofilms. Many species that predominate in disease have not been isolated from healthy sites or are found in low abundance, raising questions as to the reservoir or origin of these putative pathogens.
\nAims: This project aims to generate an in vitro model of dysbiosis to demonstrate whether it is possible to observe the outgrowth of low abundance disease-associated species from biofilms taken from healthy sites and subjects by mimicking a disease-promoting environment. 
\nMaterials and Methods: The Calgary Biofilm Device and several types of protein-rich media were used to culture five-species microbial communities. Then, the optimised model was used to culture complex biofilms using an inoculum of plaque and saliva from healthy young adult volunteers in media mimicking the nutritional status of the inflamed periodontal pocket. Later, three-week complex biofilms were cultured just in sterile human saliva to see whether changes in the enriched biofilms could be reversed. Metagenomics was used to characterise the taxonomy and functional potential of biofilms, and longitudinal comparisons were performed on biofilms and the inoculum. 
\nResults: The inoculum consisted mainly of health-associated genera, such as Streptococcus, Actinomyces and Haemophilus. After culture in various media for one or three weeks, the biofilm composition shifted and numerous fastidious and periodontal disease-associated species belonging to genera Bacteroidetes, Fretibacterium, Prevotella and Alloprevotella were enriched. These enriched biofilms, subsequently cultured solely in human saliva, showed a minor decrease in disease associated-species. There was a shift in functional activities, with cultured biofilms having a greater abundance of genes associated with virulence.
\nConclusion: The results suggest that the source of the periodontal pathogens is the healthy human mouth, and that these species can be enriched at the expense of health-associated species in a nutritional environment resembling inflammation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Qualitatif · Signal consensuel: Qualitatif
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,279
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0030,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle