Environmental <scp>DNA</scp> in lake sediment reveals biogeography of native genetic diversity
Notice bibliographique
Résumé
Understanding the historical distributions of species is vital to the conservation and restoration of native species, yet such information is often qualitative. We show that the paleolimnological history of threatened freshwater fishes can be reconstructed using species‐diagnostic markers amplified from environmental DNA deposited in lake sediments (lake sed DNA ). This method was validated through the detection of lake sed DNA from non‐native trout (Yellowstone cutthroat trout, Oncorhynchus clarkii bouvieri ), which corroborated historical records of human‐mediated introductions. We also discovered native trout (westslope cutthroat trout, Oncorhynchus clarkii lewisi ) lake sed DNA that predated human‐mediated introductions of freshwater fishes in a watershed with high topographical relief. This unexpected result revealed that the westslope population was of native origin and requires immediate conservation protection. Our findings demonstrate that lake sed DNA can be used to determine the colonization history of freshwater fishes and the structure of ecosystems, aiding in the identification of native ranges, novel native diversity, and introductions of non‐native species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,004 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».