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Enregistrement W2955885749 · doi:10.1158/1055-9965.epi-18-1215

Investigation of Leukocyte Telomere Length and Genetic Variants in Chromosome 5p15.33 as Prognostic Markers in Lung Cancer

2019· article· en· W2955885749 sur OpenAlexafffundabout
Linda Kachuri, Jens Helby, Stig E. Bojesen, David C. Christiani, Li Su, Xifeng Wu, Adonina Tardón, Guillermo Fernández‐Tardón, John K. Field, Michael P.A. Davies, Chu Chen, Gary E. Goodman, Frances A. Shepherd, Natasha B. Leighl, Ming‐Sound Tsao, Yonathan Brhane, M. Catherine Brown, Kevin Boyd, Daniel Shepshelovich, Lei Sun, Christopher I. Amos, Geoffrey Liu

Notice bibliographique

RevueCancer Epidemiology Biomarkers & Prevention · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTelomeres, Telomerase, and Senescence
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of TorontoPublic Health OntarioLunenfeld-Tanenbaum Research Institute
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésTelomereLung cancerChromosomeBiologyGeneticsCancerMedicinePathologyOncologyDNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: Lung cancer remains the leading cause of cancer mortality with relatively few prognostic biomarkers. We investigated associations with overall survival for telomere length (TL) and genetic variation in chromosome 5p15.33, an established telomere maintenance locus. Methods: Leukocyte TL was measured after diagnosis in 807 patients with non–small cell lung cancer (NSCLC) from the Princess Margaret Cancer Center in Toronto and assessed prospectively in 767 NSCLC cases from the Copenhagen City Heart Study and the Copenhagen General Population Study. Associations with all-cause mortality were tested for 723 variants in 5p15.33, genotyped in 4,672 NSCLC cases. Results: Short telomeres (≤10th percentile) were associated with poor prognosis for adenocarcinoma in both populations: TL measured 6 months after diagnosis [HR = 1.65; 95% confidence intervals (CI), 1.04–2.64] and for those diagnosed within 5 years after blood sampling (HR = 2.42; 95% CI, 1.37–4.28). Short TL was associated with mortality in never smokers with NSCLC (HR = 10.29; 95% CI, 1.86–56.86) and adenocarcinoma (HR = 11.31; 95% CI, 1.96–65.24). Analyses in 5p15.33 identified statistically significant prognostic associations for rs56266421-G in LPCAT1 (HR = 1.86; 95% CI, 1.38–2.52; P = 4.5 × 10−5) in stage I–IIIA NSCLC, and for the SLC6A3 gene with OS in females with NSCLC (P = 1.6 × 10−3). Conclusions: Our findings support the potential clinical utility of TL, particularly for adenocarcinoma patients, while associations in chromosome 5p15.33 warrant further exploration. Impact: This is the largest lung cancer study of leukocyte TL and OS, and the first to examine the impact of the timing of TL measurement. Our findings suggest that extremely short telomeres are indicative of poor prognosis in NSCLC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,331
Écart entre enseignants0,299 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2019
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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